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astringent銅蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
如何計(jì)算resp，esp，chelpg電荷
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最近看文獻(xiàn)的時(shí)候，有些用的是resp，有的是esp還有chelpg電荷，請(qǐng)問(wèn)這幾個(gè)電荷有什么區(qū)別，如果我自己用gaussian做這三種電荷，請(qǐng)問(wèn)表頭如何輸入？還需要其他軟件嗎？ 請(qǐng)大家指點(diǎn) |
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sobereva
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
本人已永久離開(kāi)小木蟲(chóng)
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【答案】應(yīng)助回帖
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astringent(金幣+15): 2012-02-03 03:15:50
gmy1990: 金幣+2 2012-05-10 14:37:42
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ESP電荷是一類(lèi)統(tǒng)稱(chēng)，包含了RESP、CHELPG等各種擬合靜電勢(shì)電荷。 比較經(jīng)典、通用的擬合靜電勢(shì)電荷是Merz-kollman(MK)電荷和CHELPG電荷。CHELPG電荷主要優(yōu)點(diǎn)是旋轉(zhuǎn)不變性好，即結(jié)果對(duì)于分子朝向敏感性很低。直接用pop=chelpg關(guān)鍵詞即可。 RESP比較適合用于生成分子力場(chǎng)的電荷，是在一般擬合靜電勢(shì)過(guò)程中加入了限制勢(shì)，使內(nèi)部原子電荷的數(shù)值不穩(wěn)定性降低，另外也考慮了解決原子電荷的等價(jià)性問(wèn)題。RESP電荷通常用AmberTools（免費(fèi)）里的Antechamber程序獲得（需要利用Gaussian產(chǎn)生的靜電勢(shì)數(shù)據(jù)作為輸入），也可以用R.E.D程序獲得。Gaussian無(wú)法直接得到RESP電荷。 |
2樓2012-02-02 06:27:31
fwenling0506
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3樓2012-05-10 10:53:49
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