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muxiachuixue木蟲 (正式寫手)
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[求助]
NBO 電荷總數(shù)不為零
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小弟最近算一個(gè)63個(gè)原子的分子，有C/H/O/N/S幾種原子，分子未經(jīng)高斯優(yōu)化，用b3lyp/6-311++g(d,p)算nbo，電荷總數(shù)為-1.8，可分子明明是中性的啊，輸入文件也規(guī)定了charge=0；再將分子用b3lyp/6-31+g(d,p)優(yōu)化，b3lyp/6-311++g(d,p)算nbo，電荷總數(shù)差不多為0 故請(qǐng)教大俠，為何未優(yōu)化之前算出的nbo電荷總和不為0呢？ 以下貼出輸入文件和輸出文件 Summary of Natural Population Analysis: Natural Population Natural ----------------------------------------------- Atom No Charge Core Valence Rydberg Total ----------------------------------------------------------------------- C 1 0.05001 1.99919 3.92264 0.02816 5.94999 N 2 -0.45280 1.99943 5.43155 0.02182 7.45280 C 3 0.09288 1.99912 3.88022 0.02778 5.90712 C 4 -0.10952 1.99892 4.09574 0.01487 6.10952 C 5 -0.06187 1.99886 4.04467 0.01833 6.06187 C 6 -0.18951 1.99908 4.17558 0.01485 6.18951 C 7 -0.12920 1.99910 4.11328 0.01681 6.12920 C 8 -0.20789 1.99915 4.19040 0.01835 6.20789 C 9 -0.17112 1.99906 4.15306 0.01900 6.17112 C 10 -0.25147 1.99862 4.22640 0.02645 6.25147 S 11 2.16679 8.10518 3.66823 2.05979 13.83321 N 12 -0.93644 1.99938 5.90754 0.02952 7.93644 C 13 -0.02604 1.99921 4.00486 0.02196 6.02604 C 14 -0.58809 1.99930 4.57808 0.01071 6.58809 O 15 -0.91952 1.99980 6.90725 0.01247 8.91952 O 16 -1.38312 1.99980 5.57151 1.81181 9.38312 C 17 -0.17626 1.99919 4.15813 0.01894 6.17626 N 18 -0.20247 1.99919 5.17253 0.03075 7.20247 N 19 -0.11881 1.99955 5.08428 0.03498 7.11881 N 20 -0.25648 1.99955 5.23112 0.02580 7.25648 C 21 0.08265 1.99898 3.88401 0.03436 5.91735 C 22 -0.05744 1.99875 4.03747 0.02122 6.05744 C 23 -0.20684 1.99916 4.16820 0.03948 6.20684 N 24 -0.81971 1.99946 5.54323 0.27703 7.81971 C 25 -0.58863 1.99919 3.56164 1.02779 6.58863 C 26 -0.01296 1.99880 3.86661 0.14755 6.01296 C 27 -0.09641 1.99886 4.06605 0.03149 6.09641 C 28 -0.39495 1.99920 4.37714 0.01861 6.39495 C 29 -0.21182 1.99923 4.15193 0.06066 6.21182 C 30 -0.06698 1.99875 4.04751 0.02072 6.06698 C 31 0.12853 1.99892 3.84499 0.02757 5.87147 N 32 -0.56214 1.99905 5.50775 0.05534 7.56214 C 33 -0.19784 1.99911 4.18066 0.01806 6.19784 C 34 -0.22406 1.99918 4.20635 0.01853 6.22406 C 35 -0.21721 1.99919 4.19905 0.01897 6.21721 C 36 -0.22166 1.99909 4.20590 0.01667 6.22166 H 37 0.19605 0.00000 0.80172 0.00224 0.80395 H 38 0.19762 0.00000 0.80102 0.00136 0.80238 H 39 0.23123 0.00000 0.76619 0.00258 0.76877 H 40 0.20967 0.00000 0.78812 0.00221 0.79033 H 41 0.21467 0.00000 0.78330 0.00203 0.78533 H 42 0.23104 0.00000 0.76526 0.00370 0.76896 H 43 0.43595 0.00000 0.56060 0.00345 0.56405 H 44 0.21792 0.00000 0.77990 0.00218 0.78208 H 45 0.20541 0.00000 0.79297 0.00163 0.79459 H 46 0.19461 0.00000 0.80352 0.00187 0.80539 H 47 0.22500 0.00000 0.77299 0.00201 0.77500 H 48 0.22843 0.00000 0.76997 0.00160 0.77157 H 49 0.23057 0.00000 0.76731 0.00212 0.76943 H 50 0.22866 0.00000 0.76901 0.00233 0.77134 H 51 0.19969 0.00000 0.79020 0.01011 0.80031 H 52 0.17823 0.00000 0.81560 0.00617 0.82177 H 53 0.01128 0.00000 0.92878 0.05994 0.98872 H 54 0.11182 0.00000 0.82727 0.06091 0.88818 H 55 0.20988 0.00000 0.78604 0.00407 0.79012 H 56 0.20393 0.00000 0.79256 0.00351 0.79607 H 57 0.22122 0.00000 0.77247 0.00631 0.77878 H 58 0.14636 0.00000 0.84176 0.01189 0.85364 H 59 0.39280 0.00000 0.60310 0.00410 0.60720 H 60 0.20923 0.00000 0.78918 0.00159 0.79077 H 61 0.20118 0.00000 0.79693 0.00189 0.79882 H 62 0.20196 0.00000 0.79625 0.00179 0.79804 H 63 0.19995 0.00000 0.79774 0.00231 0.80005 ======================================================================= * Total * -1.80404 78.07562 181.42533 6.30308 265.80404 |
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quantumor
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2樓2012-02-17 13:55:17
muxiachuixue
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你好，我發(fā)郵件問了高斯官方，高斯官方給的建議是加上IOp(6/76=8)來提高線性相關(guān)的標(biāo)準(zhǔn)，經(jīng)測(cè)試，電荷總和已正常，以下是gaussian的回復(fù)： If you look at the beginning of the NBO analysis you will see the problem, Remove ICRem= 289 ICRemI= 290 L=0 PNAO number 289 atom 14 type 51 NPNAO= 520 due to symmetric orthogonalization 2, value= 0.00D+00. Computed number of electrons 148.18290763 does not match expected value of 148. where the program was having some problems orthogonalizing the basis set. We have seen this with some other calculations with diffuse basis sets and sometimes tightening the criteria for linear dependence will help. Using # rb3lyp/6-311++g(d,p) pop=npa IOp(6/76=8) which changes it from 10^-6 to 10^-8 will still be stable and yet correct the removal of important contributions. |
3樓2012-03-08 18:46:10
quantumor
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4樓2012-03-09 09:37:09
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