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tianxingling金蟲 (正式寫手)
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[交流]
石墨烯結(jié)構(gòu)文件的生成 已有3人參與
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看了一些帖子,有不同的方法來建立石墨烯模型 我想利用編程的方式來生成石墨烯的gro結(jié)構(gòu)文件,應(yīng)該怎樣實(shí)現(xiàn)呢? |
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那建議直接使用VMD來建模,更方便,步奏: Extensions —>Modeling —>Inorganic Builder—>InorganicBuilder—>Task—>Build device , 在Material 一欄里選擇 Graphite ,Box dimension 就可以選擇大小. Add exclusion 一欄里可以選擇形狀。 [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-2-19 at 13:42 ] |
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我沒有做過,根據(jù)我看過的一個(gè)論文:ACS nano 《Computational Investigation of DNA Detection Using Graphene Nanopores》 ,System Setup 部分就有石墨烯的晶格參數(shù)。根據(jù)這些晶格參數(shù)來生成一個(gè)單元中每個(gè)石墨烯碳原子的坐標(biāo)位置。 再根據(jù)你所需要的大小,來復(fù)制擴(kuò)展到滿意的大小。 PS 干嘛還要自己編程寫呢? 貌似VMD就能直接生成啊,最重要的是得到模擬的參數(shù)文件吧。 |
金蟲 (正式寫手)
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