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sunwujin2006鐵桿木蟲 (小有名氣)
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[求助]
Discovery studio2.5 中ZDOCK 對接的蛋白總是疊合在一起
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小弟對于模擬是新手，懇請各位大俠指教 最近要模擬一個蛋白，文獻(xiàn)中描述是四聚體，而其模板pdb code： 1S1M 只給出了二聚體，其它更接近的模板最多就是二聚體。沒有搜到類似的四聚體模板來superimpose出四聚體的結(jié)構(gòu)。 由于文獻(xiàn)中描述了四聚體的結(jié)合位點，我就嘗試用DS2.5中的Zdock來對接兩個二聚體。而Zdock的結(jié)果總是將兩個蛋白疊合在一起，而不是對接起來。我再嘗試其他一些小的蛋白，結(jié)果也是疊合起來了。 我的DS2.5是在電驢上下的，不是正版的 不知道有沒有人遇到過類似的情況，還請多多指教，謝謝！ |
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2樓2021-04-23 11:47:40
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