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crispsoft

金蟲 (小有名氣)

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金幣: 1338.1
散金: 11
帖子: 76
在線: 82.5小時(shí)
蟲號(hào): 628150
注冊(cè): 2008-10-16
專業(yè): 合成藥物化學(xué)

[求助] 請(qǐng)教：分子對(duì)接后的comsia計(jì)算的時(shí)候提示沒有電荷

請(qǐng)各位指教;用surflex docking對(duì)接完成以后，把構(gòu)象讀入新建的數(shù)據(jù)庫(kù)，然后做成分子表格，進(jìn)行comsia計(jì)算的時(shí)候提示沒有電荷，結(jié)果靜電場(chǎng)和H供體這兩項(xiàng)就無法計(jì)算，這是怎么回事��？
如console中提示：
Unable to compute electrostatic field; comp01_000 has no charges
BAD_FILE - File is not in field format.
我之前用fit atom 疊合形成MSS去計(jì)算的comsia和comfa結(jié)果都是正常的��？
對(duì)接后把構(gòu)象對(duì)入數(shù)據(jù)庫(kù)前要再做什么操作��？
我之前在繪制分子的時(shí)候已經(jīng)tripos力場(chǎng)下加過G-H電荷并優(yōu)化了啊
謝謝！

剛才我用MSS菜單中的charge項(xiàng)，這樣做對(duì)不對(duì)��？

另外，文獻(xiàn)中常常說對(duì)接后得分最高的構(gòu)象未必是合適的，需要用LOO看q2來確定最佳構(gòu)象，這個(gè)應(yīng)該怎么做啊？

[ Last edited by crispsoft on 2012-2-22 at 17:35 ]

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1樓 2012-02-22 16:23:47

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