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lyl2ds銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
求助-基因克隆及引物設(shè)計的問題
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| 我現(xiàn)在想克隆出一段基因，需要設(shè)計簡并引物，我又7條序列通過clustal比對找出了保守區(qū)，想將這保守區(qū)的全長克隆出來，想請教下高人，幫我設(shè)計下簡并引物！我是新手，請各位高人指教！ |
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2012-03-06 16:42:41, 15.85 K
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
小丹木木: 金幣+2, 鼓勵應(yīng)助，歡迎常來 2012-06-08 13:52:00
小丹木木: 金幣+2, 鼓勵應(yīng)助，歡迎常來 2012-06-08 13:52:00
我們碰到的問題是一樣的，所用的方法也是一樣的，我要克隆的是某物種MHC的基因，您的第一步也是提取總的RNA和DNA吧，呵呵，我也在設(shè)計引物，準(zhǔn)備以總RNA中相應(yīng)的mRNA為模板RTPCR得到cDNA的第一條鏈，通過對7條其他物種MHC的mRNA的序列比對（用clustalx）找到了相對保守的序列，打算在5·端設(shè)計一個特異性引物，3·端先設(shè)計特異引物，不行就用Oligo（dT）；另一方面，根據(jù)文獻(xiàn)中給出的cDNA序列找到同源性較高的區(qū)段，重新設(shè)計引物，以總DNA為模板PCR，對擴增出來的片段和DNA模板進行測序。兩者比較可以找到相應(yīng)的外顯子和內(nèi)含子序列。我也是分子新手，不敢確定這樣做到底對不對，但還是希望能幫到您。 |
7樓2012-06-08 10:41:11
lyl2ds
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2樓2012-03-06 16:47:27
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lyl2ds3樓2012-03-08 17:28:07
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4樓2012-03-08 20:26:42
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