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fannieyang金蟲 (小有名氣)
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[交流]
請(qǐng)教各位，分子動(dòng)力學(xué)模擬NVE系統(tǒng)，不對(duì)速度進(jìn)行標(biāo)度可以嗎？ 已有5人參與
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初始設(shè)定好一個(gè)速度分布，數(shù)值求解運(yùn)動(dòng)方程，能量應(yīng)該會(huì)一直守恒吧？ 相對(duì)于有熱浴作用的NVT系統(tǒng)，是不是孤立的NVE系統(tǒng)達(dá)到平衡態(tài)的時(shí)間更長呢？多謝~~ |
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ChemiAndy
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3樓2012-03-13 04:01:42
ChemiAndy
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小木蟲(金幣+0.5): 給個(gè)紅包，謝謝回帖
zh1987hs(金幣+5): 謝謝 2012-03-13 07:55:53
小木蟲(金幣+0.5): 給個(gè)紅包，謝謝回帖
zh1987hs(金幣+5): 謝謝 2012-03-13 07:55:53
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(1) 是的，如果動(dòng)力學(xué)積分算法的精確性足夠高的話。我曾經(jīng)遇到一個(gè)晶體模擬，需要使用4級(jí)Rung-Kuta算法才能保證能量守恒。Verlet失效。但是，對(duì)于一般體系我相信Verlet足夠好了。 (2) NVE和NVT哪個(gè)更快弛豫到平衡狀態(tài)，沒有比較過。應(yīng)該差不太多。這個(gè)應(yīng)該與盒子大小，體系柔性，初始構(gòu)型有關(guān)。一般小分子溶液體系可在約數(shù)個(gè)ps級(jí)別內(nèi)能夠達(dá)到能量、溫度平衡。 |
2樓2012-03-13 03:59:34
4樓2012-03-13 22:52:56
ChemiAndy
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5樓2012-03-14 01:52:28
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