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ZOEY21金蟲 (小有名氣)
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用phylip建樹如何設(shè)多個外群
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| 如題 我看有的文獻(xiàn)做的樹外群都有很多個的，那么請問 用phylip建立系統(tǒng)進(jìn)化樹如何設(shè)多個外群？還是只能設(shè)一個外群？還有我的樹建好后用treeview查看都看不到自檢值的？是樹建的太差了嗎？求大家?guī)兔Π?img src="https://muchongimg.xmcimg.com/data/emuch_bbs_images/smilies/tiger/09.gif" align="absmiddle" border="0"> |
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rommel1941
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 專業(yè)人士��！ 2012-03-14 22:37:18
西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 專業(yè)人士��！ 2012-03-14 22:37:18
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這個要看你研究的內(nèi)容了，如果是近緣種之間的關(guān)系，不僅是NJ樹，最好輔助以Bayes和ML樹，這些都有對應(yīng)的軟件�；蛘呤褂肕EGA也可以做初步的分析，只是發(fā)文章的時候效果不如其他專業(yè)軟件來的有說服力。 關(guān)于外群的選擇還是要針對情況，如果選的太遠(yuǎn)，內(nèi)部分枝會很短，不利于討論問題，太近的話可能無法有效分開，這還是基于你研究的問題而定。 得到樹后，有很多軟件可以輔助畫樹，如Figtree等。 希望對你有幫助，如果你在北京，我們可以當(dāng)面聯(lián)系，看看你的數(shù)據(jù)再說 |
4樓2012-03-14 22:26:07
rommel1941
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2樓2012-03-14 13:17:39
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3樓2012-03-14 17:24:50
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