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ZOEY21金蟲 (小有名氣)
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[求助]
用phylip建樹如何設(shè)多個(gè)外群
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| 如題 我看有的文獻(xiàn)做的樹外群都有很多個(gè)的,那么請(qǐng)問 用phylip建立系統(tǒng)進(jìn)化樹如何設(shè)多個(gè)外群?還是只能設(shè)一個(gè)外群?還有我的樹建好后用treeview查看都看不到自檢值的?是樹建的太差了嗎?求大家?guī)兔Π?img src="https://muchongimg.xmcimg.com/data/emuch_bbs_images/smilies/tiger/09.gif" align="absmiddle" border="0"> |
【分子生物】EPI帖 |
金蟲 (小有名氣)
鐵桿木蟲 (正式寫手)
情定山河

鐵桿木蟲 (正式寫手)
情定山河
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這個(gè)要看你研究的內(nèi)容了,如果是近緣種之間的關(guān)系,不僅是NJ樹,最好輔助以Bayes和ML樹,這些都有對(duì)應(yīng)的軟件;蛘呤褂肕EGA也可以做初步的分析,只是發(fā)文章的時(shí)候效果不如其他專業(yè)軟件來的有說服力。 關(guān)于外群的選擇還是要針對(duì)情況,如果選的太遠(yuǎn),內(nèi)部分枝會(huì)很短,不利于討論問題,太近的話可能無法有效分開,這還是基于你研究的問題而定。 得到樹后,有很多軟件可以輔助畫樹,如Figtree等。 希望對(duì)你有幫助,如果你在北京,我們可以當(dāng)面聯(lián)系,看看你的數(shù)據(jù)再說 |

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