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c_chi木蟲 (正式寫手)
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[求助]
差分與二次差分電荷密度
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我現(xiàn)在需要算一個(gè)吸附問題,原子A吸附到結(jié)構(gòu)B上,最終體系為C; 我理解的差分是C的電荷密度減去A和B的電荷密度,可以看出吸附處的吸附和成鍵情況;而二次差分是C減去C中每個(gè)原子的單獨(dú)的電荷密度。 現(xiàn)在有兩個(gè)問題: 我理解的兩個(gè)差分圖有錯(cuò)誤沒有,他們分別可以做什么分析?什么情況下做什么差分? 我想用siesta畫出這兩個(gè)差分圖,二次差分直接用輸出文件用dentchar處理得到二次差分,差分可以將A B C的結(jié)果中的電荷文件相減再畫圖。是這樣處理嗎?還是有更簡單的方法?或者大家有比較好的matlab腳本去畫這兩類差分圖?或者其他作圖方法 先謝謝大家給出幫助了。 |
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (著名寫手)
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對于你的這個(gè)兩個(gè)差分的用途我也不清楚,一起學(xué)習(xí)。靜等高手解釋。 對于那兩個(gè)差分電荷的做法用denchar可以的。另外感覺用denchar有點(diǎn)麻煩,畢竟需要做輸入文件,還有一些參數(shù)的定義。實(shí)際上可以用rho2cube文件或者grid2cube來做。先做成cube文件。然后對cube文件操作。http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2482325&fpage=1 |

鐵桿木蟲 (小有名氣)

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