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[求助]
如何計算點到面與面到面的距離和相關(guān)偏差?
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計算點到面 或者 二面角, 是以在.ins加mpla命令還是在diamond中計算為準?好像兩者計算出來的不一樣,兩者計算的數(shù)據(jù)括號內(nèi)都有誤差值,不過可能論文中以ins計算為好? 這樣有個問題:.ins中,對稱操作產(chǎn)生的原子,如O2A,N1B等計算不進平面啊,像這樣mpla O1 O2A...就不行了,怎么辦呢? |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
至尊木蟲 (職業(yè)作家)

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傳說中的XI2004老師果然厲害。 我想計算 N2 到 平面O1 N1 O2 O3A 的距離,找到O3的操作碼,命令格式如下: eqiv $1 -0.5-x,0.5+y,0.5-z MPLA 4 O1 N1 O2 O3_$1 N2 得到: Least-squares planes (x,y,z in crystal coordinates) and deviations from them (* indicates atom used to define plane) * -0.1566 (0.0017) O1 * 0.7543 (0.0021) N1 * -0.8345 (0.0022) O2 * 0.2368 (0.0010) O3_$1 -0.1484 (0.0051) N2 這樣的命令沒錯吧? 還有計算出來的距離是-0.1484 (0.0051),負的? |
至尊木蟲 (職業(yè)作家)

至尊木蟲 (職業(yè)作家)

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5.9865 (0.0092) x + 4.6084 (0.0041) y - 10.3871 (0.0157) z = 1.2586 (0.0070) * 0.2111 (0.0012) O1 * -0.2511 (0.0014) N1 * 0.2384 (0.0014) O2 * -0.1984 (0.0011) O3_$1 0.3245 (0.0013) Co1 Rms deviation of fitted atoms = 0.2257 是,之前找錯了,改正后,我算co到平面的距離 結(jié)果上,平面性還行吧? 總的額來說,學會了一個命令。其實之前你發(fā)過生成氫鍵表的帖子,收益良多,很牛很熱心,真的謝謝! 也祝您每天好心情! |
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