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如何計(jì)算點(diǎn)到面與面到面的距離和相關(guān)偏差？
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計(jì)算點(diǎn)到面 或者 二面角, 是以在.ins加mpla命令還是在diamond中計(jì)算為準(zhǔn)？好像兩者計(jì)算出來的不一樣，兩者計(jì)算的數(shù)據(jù)括號(hào)內(nèi)都有誤差值，不過可能論文中以ins計(jì)算為好？ 這樣有個(gè)問題：.ins中，對(duì)稱操作產(chǎn)生的原子，如O2A，N1B等計(jì)算不進(jìn)平面啊，像這樣mpla O1 O2A...就不行了，怎么辦呢？ |
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鐵桿木蟲 (正式寫手)
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2樓2012-03-29 15:23:08
3樓2012-03-30 08:36:27
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4樓2012-03-30 09:12:30
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傳說中的XI2004老師果然厲害。 我想計(jì)算 N2 到 平面O1 N1 O2 O3A 的距離，找到O3的操作碼，命令格式如下： eqiv $1 -0.5-x,0.5+y,0.5-z MPLA 4 O1 N1 O2 O3_$1 N2 得到： Least-squares planes (x,y,z in crystal coordinates) and deviations from them (* indicates atom used to define plane) * -0.1566 (0.0017) O1 * 0.7543 (0.0021) N1 * -0.8345 (0.0022) O2 * 0.2368 (0.0010) O3_$1 -0.1484 (0.0051) N2 這樣的命令沒錯(cuò)吧？ 還有計(jì)算出來的距離是-0.1484 (0.0051)，負(fù)的？ |
5樓2012-03-30 11:11:08
xi2004
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8樓2012-03-30 12:24:26
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5.9865 (0.0092) x + 4.6084 (0.0041) y - 10.3871 (0.0157) z = 1.2586 (0.0070) * 0.2111 (0.0012) O1 * -0.2511 (0.0014) N1 * 0.2384 (0.0014) O2 * -0.1984 (0.0011) O3_$1 0.3245 (0.0013) Co1 Rms deviation of fitted atoms = 0.2257 是，之前找錯(cuò)了，改正后，我算co到平面的距離 結(jié)果上，平面性還行吧？ 總的額來說，學(xué)會(huì)了一個(gè)命令。其實(shí)之前你發(fā)過生成氫鍵表的帖子，收益良多，很牛很熱心，真的謝謝！ 也祝您每天好心情！ |
9樓2012-03-30 12:36:55
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