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souledge專(zhuān)家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
使用PGI編譯VASP中無(wú)法使用長(zhǎng)數(shù)組
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使用PGI最新的12.3 Workstation版（2周試用許可證），MPICH2（configure OpenMPI時(shí)出錯(cuò)失敗~），編譯了VASP 4.6.28。 把makefile.linux_pg_opt稍微修改一下，最關(guān)鍵的是修改處理器類(lèi)型，去掉-i8，就可以成功編譯VASP了，結(jié)果沒(méi)有問(wèn)題。 但是看到pgif90的幫助文件上有參數(shù)： -Mlarge_arrays -Mnolarge_arrays (default) (linux86-64 only). Allow (don't allow) arrays larger than 2GB; -Mlarge_arrays is default with -mcmodel=medium. 想到使用ifort時(shí)，如果不使用-heap-arrays，就會(huì)在計(jì)算大體系時(shí)容易內(nèi)存溢出然后停止計(jì)算，于是也就在PGI的編譯上使用了-Mlarge_arrays，結(jié)果，計(jì)算哪怕是個(gè)非常簡(jiǎn)單的結(jié)構(gòu)時(shí)，也會(huì)在reading WAVECAR后出現(xiàn)錯(cuò)誤： internal ERROR: SETYLM, insufficient INDMAX workspace 比較郁悶和搞笑的是，這個(gè)錯(cuò)誤在VASP的官方論壇里看，是使用ifort編譯的，并且解決方案恰恰就是添加-heap-arrays…… 于是實(shí)在想不出解決方法來(lái)了，來(lái)看看大家有什么解決方案沒(méi)…… |
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souledge
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賀儀: 金幣+1, 謝謝參與討論 2012-04-04 13:26:37
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新的一個(gè)測(cè)試結(jié)果，計(jì)算一個(gè)64個(gè)原子的四方對(duì)稱(chēng)模型，單核運(yùn)行沒(méi)有使用-Mlarge_arrays編譯的VASP，居然占用內(nèi)存6GB，并且沒(méi)有出錯(cuò)。等待了半個(gè)小時(shí)，出現(xiàn)了第一個(gè)SCF步～不繼續(xù)等了～先發(fā)一個(gè)運(yùn)行中的資源截圖。是否這意味著使用PGI的話(huà)無(wú)需考慮傳說(shuō)中的2GB數(shù)組限制問(wèn)題呢？ |
4樓2012-04-04 00:02:49
thinkllh
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2樓2012-04-03 22:58:13
souledge
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3樓2012-04-03 23:28:28
【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
fzx2008: 金幣+1, 謝謝指教 2012-04-04 18:08:11
souledge: 金幣+20, ★★★★★最佳答案, Puts automatic arrays and arrays created for temporary computations on the heap instead of the stack. 2012-04-04 19:38:51
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
fzx2008: 金幣+1, 謝謝指教 2012-04-04 18:08:11
souledge: 金幣+20, ★★★★★最佳答案, Puts automatic arrays and arrays created for temporary computations on the heap instead of the stack. 2012-04-04 19:38:51
| 一般不會(huì)有哪個(gè)程序一次allocate2GB的數(shù)組。heap-array是為了把內(nèi)存申請(qǐng)從棧上移到堆上。 |
5樓2012-04-04 17:55:12
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