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關于 VASP 的編譯經(jīng)驗分享
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（本文首發(fā)于 中國科學院大學 凝聚態(tài)理論與計算材料物理實驗室論壇，轉載請注明出處！ http://tcmp2.ucas.ac.cn/bbs/-/message_boards/view_message/34944） 關于 VASP 的編譯，最近有一些心得體會，寫出來拋磚引玉，與大家共享： 1) 首先是編譯環(huán)境的配置： VASP 并行版本的編譯（串行版本的不常用）需要如下工具： Intel Fortran Compiler : ifort 并行編譯器：mpif90 或者 mpiifort 數(shù)學庫：一般常用Intel MKL，如果有其他的當然也可以 關于 Fortran 編譯器，我們一般Intel架構的機器好像只能使用ifort來編譯，如果使用GNU開發(fā)的gfortran編譯，就是一個大大的杯具。從Intel 官網(wǎng)上可以下載Fortran編譯器： http://software.intel.com/en-us/ ... -evaluation-options 安裝Fortran 編譯器的時候好像會自動把MKL安裝上，很是省事。當然，編譯器和數(shù)學庫的安裝是需要許可證的，這個事情 … 大家都是盜版磚家，神通廣大，深藏不露，這里我就不羅嗦了！其實Intel會有提供30天的試用版本，可以嘗試。 關于并行編譯器，可以使用 openmpi mpich IntelMPI 等等，安裝的事情我不想多說了，DEB系列的系統(tǒng)直接apt-get install，其他系列的我不是很了解。當然可以從源代碼編譯安裝，或者比如Intel的并行開發(fā)運行環(huán)境，從官網(wǎng)或者其他途徑下載安裝包，安裝起來應該不是特別復雜。 需要注意的是，使用哪種MPI編譯，就要使用對應的mpirun來并行運行，它們互相之間好像是不兼容，記得好好設置 PATH LD_LIBRARY_PATH 兩個變量。VASP 運行時是一撲成吊絲，還是一飛成高富帥，它們有關鍵性的作用。 2) 關于 VASP 的編譯 1. 在 vasp.x.lib 中執(zhí)行 make，可能需要先把 makefile.linux_ifc_P4 復制為 makefile ，并將其中的 FC=ifc 改為 FC=ifort。 這一步應該是非常easy的！ 2. 接下來的才是重頭戲，切換工作目錄到 vasp.x.x ，就是VASP源代碼，在這里，首先要好好地修改 makefile： 同樣，我們從 makefile.linux_ifc_P4 開始，把它復制為 makefile ，然后用純文本編輯器，比如VIM，打開。其中幾個比較關鍵的變量給出設置模板如下： FC=mpiifort -heap-arrays MKLPATH=/share/apps/Intel.Fortran.Compiler.2013.1.117/mkl FFLAGS = -I$(MKLPATH)/include/fftw -FR -lowercase -assume byterecl BLAS= -L$(MKLPATH)/lib/intel64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lmkl_intel_lp64 LAPACK= -L$(MKLPATH)/lib/intel64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lmkl_intel_lp64 SCA= -L$(MKLPATH)/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64.a -lmkl_blacs_intelmpi_lp64.a 或者 SCA= -L$(MKLPATH)/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 另外，關于FFT函數(shù)庫，有兩種選擇，對于以前的Intel數(shù)學庫，好像只支持 FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dfurth.o fft3dlib.o 而2013年新的數(shù)學庫支持一個更快的FFT函數(shù)庫，這時可以采用如下設置： FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o 可能需要針對 fftw3d.o 設置特殊的編譯規(guī)則： fftw3d.o : fftw3d.F $(CPP) $(FC) -I$(MKLPATH)/include/fftw -FR -lowercase -O1 $(INCS) -c $*$(SUFFIX) 或者干脆直接設置 INCS = -I$(MKLPATH)/include/fftw 關于 makefile 中變量的設置，就說這么多。這里面的事情，參考著上面給出的示例，自己捉摸一下應該沒有太大的問題，都懂的，說太多就沒意思了，點到為止。 好吧，再嘮叨幾句： 如果不是使用 mpiifort 來編譯的話，比如是 mpif90，記得將其調用的 fortran 編譯器設置為 ifort 。有兩種方式：一是重新編譯并行編譯器，在編譯選項中指定其調用的Fortran編譯器，這種方式可能有點麻煩；二是采用比較取巧的方法，由于mpif90默認調用gfortran作為Fortran編譯器，那我們做一個符號鏈接就可以了：gfortran -> ifort。另外需要注意的是，可能同時得修改 BLAS LAPACK 和 SCA 變量中的部分鏈接庫名字，詳情請參考 makefile ，因為其中默認是使用 mpif90 編譯器。 到這里，關于makefile的修改應該就差不多了，保存退出后執(zhí)行 make ，如果人品足夠好，一般等上十分鐘二十分鐘的就可以得到編譯好的可執(zhí)行 vasp 二進制文件。這里有一個小技巧：直接執(zhí)行make編譯是順序進行的，如果使用 make -j N ，則可以同時并發(fā)N個編譯，速度會快上很多（N倍？）。但是由于makefile中沒有針對并發(fā)編譯做特殊的處理，所以這樣操作很容易出錯。當然，出來混，拼的就是人品！如果出錯退出了，不用捉急，一般是由于編譯過程的沖突導致的，再執(zhí)行make順序編譯過這一段，接下來再并發(fā)編譯，照樣是可以的。 最后，編譯過程中遇到問題的時候，不要難過，搞個兩三天才編譯通過是很正常的事情，要淡定，要多上網(wǎng)搜，要多看VASP the GUIDE中的第三節(jié)：The installation of VASP，其中有很詳細的解釋。另外，VASP the GUIDE中有一些關于優(yōu)化執(zhí)行效率的討論，很有參考價值，要深入學習，領會精神！ 祝編譯順利，VASP開發(fā)小組與我們同在！ 2013-06-15 秦光照 |
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15樓2015-03-10 22:22:43
謝謝經(jīng)驗分享，試試看 2樓2013-06-15 17:01:30
3樓2013-06-17 00:49:22
5樓2013-06-18 18:48:48
呀呀！6樓2013-06-18 22:42:06
8樓2014-08-26 14:38:01
9樓2014-08-26 17:25:43
10樓2014-08-26 17:44:07
11樓2014-08-27 00:42:14
12樓2014-08-27 09:19:23
13樓2014-08-27 14:48:40
16樓2015-03-18 15:30:48
17樓2015-10-07 16:45:12
簡單回復
2013-06-17 18:52
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五星好評 謝謝分享。
blueybz7樓
2013-06-21 15:01
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高朋滿座00714樓
2014-09-28 21:59
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