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[求助]
再次求問，差分電荷密度圖的定性分析
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已經(jīng)通過能量得出了結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的判斷，想通過差分電荷密度圖定性分析下不同結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性差距的物理機(jī)制。如圖。我知道可以從電負(fù)性的角度去解釋，即兩個(gè)電負(fù)性較大的原子在一起會(huì)有較大的庫倫排斥力，而它們中間有一個(gè)電負(fù)性較弱的引入后會(huì)減弱這種庫倫排斥力。我想知道的是能否從差分電荷密度圖上，從電子轉(zhuǎn)移上來定性的分析下原子間的相互作用。求幫助。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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WDD880227: 金幣+1, 謝謝指教 2012-11-28 14:35:31
WDD880227: 金幣+1, 謝謝指教 2012-11-28 14:35:31
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view--->toolbars--->volume visualization, 可以調(diào)出creat slices,這樣就可以選擇2D 的electron density，然后選中這個(gè)slice，在properties中修改 slice crystal direction(修改所取面的晶向)，修改slice fractional postion(修改你所取的面的確定位置)，然后從工具欄選擇color map, 即可得到想要的面的電荷密度。 |
15樓2012-11-28 14:02:04
★ ★
fzx2008: 金幣+2, 謝謝交流！ 2012-05-08 12:17:48
fzx2008: 金幣+2, 謝謝交流！ 2012-05-08 12:17:48
| 還是來做個(gè)了結(jié)吧。差分電荷密度圖確實(shí)能比較清楚的看出電子得失的情況，但仍只是一種定性的判定化學(xué)鍵的方法。至于我求問的其和體系能量的關(guān)系，這種圖所能提供的信息更是有限。定量的辦法是用VASP把Kohn-Sham總能中的經(jīng)典Coulomb排斥能拆解出來進(jìn)行對(duì)比。還有一種比較直觀的判斷成鍵作用的方法就是做Mulliken population analysis，直接看鍵布局?jǐn)?shù)或原子布局?jǐn)?shù)，但據(jù)說這種方法已經(jīng)有些過時(shí)了。 |
5樓2012-04-20 23:07:48
★ ★
sunyang1988: 金幣+2, 謝謝幫助 2012-07-19 22:45:46
sunyang1988: 金幣+2, 謝謝幫助 2012-07-19 22:45:46
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這是做的差分電荷密度分析，用來比較直觀的比較各原子的電子得失，但好像大多文章里邊做的不是差分電荷圖，而是直接做電荷密度圖，不過方法是一樣的。 可以在結(jié)構(gòu)優(yōu)化完成后，選擇energy或properties里邊的electron density一項(xiàng)進(jìn)行運(yùn)算，對(duì)話框下邊有差分電荷密度計(jì)算的選項(xiàng)。計(jì)算完成后analysis→electron density→import，然后右鍵→display style，在isosurface一項(xiàng)里可以設(shè)置你要分析的原子面，在右鍵→color maps里邊可以調(diào)節(jié)color mapping值來達(dá)到想要的色彩值區(qū)分效果。 |
9樓2012-07-19 12:08:43
13樓2012-09-20 11:29:32
uuv2010
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2樓2012-04-07 18:40:26
★ ★
fzx2008: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2012-05-08 12:17:28
fzx2008: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2012-05-08 12:17:28
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是在晶硅中摻雜替代位的P原子，通過能量比較來判斷P與間隙位的氧原子的相互作用及其相互作用對(duì)體系能量的影響。 最下邊兩幅圖是P和O分別在第一和第二近鄰位時(shí)的差分電荷密度。P-O直接鍵合時(shí)體系是不穩(wěn)定的；而在第二近鄰位鍵合時(shí)體系穩(wěn)定。 P-O的相互作用導(dǎo)致體系能量變化及穩(wěn)定性的差異肯定是與P，Si，O原子相互作用時(shí)的電荷相互作用相關(guān)的。問題是如何把圖中電荷轉(zhuǎn)移與體系穩(wěn)定性聯(lián)系起來。 我是初次做這種圖，物理基礎(chǔ)也比較薄弱，所以分析起來比較困難。 |
3樓2012-04-07 22:24:01
s20080718
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7樓2012-07-14 20:16:37
8樓2012-07-17 08:45:50
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sunyang1988: 金幣+2, 謝謝交流 2012-07-20 10:15:53
sunyang1988: 金幣+2, 謝謝交流 2012-07-20 10:15:53
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這是做的差分電荷密度分析，用來比較直觀的比較各原子的電子得失，但好像大多文章里邊做的不是差分電荷圖，而是直接做電荷密度圖，不過方法是一樣的。 可以在結(jié)構(gòu)優(yōu)化完成后，選擇energy或properties里邊的electron density一項(xiàng)進(jìn)行運(yùn)算，對(duì)話框下邊有差分電荷密度計(jì)算的選項(xiàng)。計(jì)算完成后analysis→electron density→import，然后右鍵→display style，在isosurface一項(xiàng)里可以設(shè)置你要分析的原子面，在右鍵→color maps里邊可以調(diào)節(jié)color mapping值來達(dá)到想要的色彩值區(qū)分效果。 |
10樓2012-07-19 12:09:08
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