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古木天恕木蟲 (正式寫手)
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[求助]
進(jìn)化樹N-J法模型選擇
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| 求助!大家進(jìn)化樹都用的什么模型?做出來的差別大嗎? |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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一般來說 進(jìn)化樹都是用NJ模型 做出來的差別大不大不跟模型相關(guān),跟你在GenBank篩選用來做進(jìn)化樹的基因序列的親緣性遠(yuǎn)近有關(guān)。 這個(gè)東西一句兩句說不清楚,給你舉個(gè)例子吧: A跟B是親戚,直系; A跟C是旁親,A跟D是路人,A是黃種人,E是白人,F(xiàn)是黑人。 好了,選取這幾個(gè)標(biāo)本用來做進(jìn)化樹,做出來梯度是非常分明的,一般沒什么問題,可信度也不錯(cuò)。 如果你選擇的是A跟M是直系,A跟N是直系,A跟O是直系,A跟P是直系。 這幾個(gè)做,做出來非常難看。生物信息學(xué)的東西,你去看看,有用。 加我好友吧,我分享給你一個(gè)生物信息學(xué)進(jìn)化樹制作專題。 這個(gè)是我的老師做的課件PPT,你不要外傳。 |
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鐵桿木蟲 (著名寫手)
新蟲 (初入文壇)
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金蟲 (小有名氣)
鐵蟲 (初入文壇)
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