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古木天恕木蟲 (正式寫手)
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[求助]
進(jìn)化樹N-J法模型選擇
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| 求助！大家進(jìn)化樹都用的什么模型？做出來的差別大嗎？ |
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7樓2015-10-30 23:05:12
molecula
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
古木天恕: 金幣+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
古木天恕: 金幣+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
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一般來說 進(jìn)化樹都是用NJ模型 做出來的差別大不大不跟模型相關(guān)，跟你在GenBank篩選用來做進(jìn)化樹的基因序列的親緣性遠(yuǎn)近有關(guān)。 這個(gè)東西一句兩句說不清楚，給你舉個(gè)例子吧： A跟B是親戚，直系； A跟C是旁親，A跟D是路人，A是黃種人，E是白人，F(xiàn)是黑人。 好了，選取這幾個(gè)標(biāo)本用來做進(jìn)化樹，做出來梯度是非常分明的，一般沒什么問題，可信度也不錯(cuò)。 如果你選擇的是A跟M是直系，A跟N是直系，A跟O是直系，A跟P是直系。 這幾個(gè)做，做出來非常難看。生物信息學(xué)的東西，你去看看，有用。 加我好友吧，我分享給你一個(gè)生物信息學(xué)進(jìn)化樹制作專題。 這個(gè)是我的老師做的課件PPT，你不要外傳。 |
2樓2012-04-08 23:59:48
molecula
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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4樓2012-04-09 00:00:55
木子雪
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5樓2013-01-19 23:25:49
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