 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1616 | 回復: 3 | ||
女巫的小木屋金蟲 (正式寫手)
|
[求助]
高斯尋找過渡態(tài)，distance matrix出錯，請高手幫我看看
|
|
本人采用高斯的QST2方法計算過渡態(tài)，反應物和產物都是經過優(yōu)化的，但是出現(xiàn)31和32 原子的Problem with the distance matrix錯誤，不知道該如何修改或者換用別的方法�，F(xiàn)附上輸入文件，31和32 就是倒數第一個和倒數第二個原子。請高手幫我看一下。先謝過了 %chk=C:\g09w\help\ZLJ\QST2\QST2.chk # opt=qst2 b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity 1 0 1 C -2.65654600 0.15107300 -0.11146000 C -1.79767600 -0.95045500 -0.13016100 C -0.41968500 -0.75801000 -0.10648100 C -0.77626500 1.63896300 -0.07409400 C -2.15285300 1.45260200 -0.08990200 H -2.20691200 -1.95457000 -0.18308900 H 0.25200900 -1.60785500 -0.11769300 H -0.38016600 2.65158300 -0.06536000 H -2.83457900 2.29650000 -0.10532000 S -4.43794300 -0.10013700 -0.12593500 O -5.06827500 1.16570200 -0.53585500 O -4.71912900 -1.35572000 -0.83919600 C 0.11959500 0.54607200 -0.07541200 C 1.54400500 0.87540800 -0.05909100 H 1.71480000 1.95097800 -0.08462200 C -4.84764200 -0.36782300 1.61847500 H -4.32027600 -1.25215500 1.98123900 H -4.57251500 0.51870400 2.19311300 H -5.92825100 -0.52699100 1.65834200 C 2.67204200 0.12433600 -0.02130800 C 4.86230800 -0.33810500 0.01884000 C 2.96540300 -1.37315900 0.00948500 O 2.14461300 -2.27671500 0.00737400 N 4.34490300 -1.54224800 0.02357300 N 6.20433100 -0.10837800 0.07519100 H 6.57952100 0.70954800 -0.38443200 H 6.75481800 -0.94964400 -0.04233800 N 3.95810000 0.70196100 0.00191300 C 4.24766600 2.11354500 0.15187300 H 5.28793700 2.24448200 0.45591800 H 4.07140200 2.66766600 -0.77838200 H 3.61817600 2.54177700 0.93969700 1 2 1.5 5 1.5 10 1.0 2 3 1.5 6 1.0 3 7 1.0 13 1.5 4 5 1.5 8 1.0 13 1.5 5 9 1.0 6 7 8 9 10 11 2.0 12 2.0 16 1.0 11 12 13 14 1.0 14 15 1.0 20 2.0 15 16 17 1.0 18 1.0 19 1.0 17 18 19 20 22 1.0 28 1.0 21 24 2.0 28 1.5 25 1.5 22 24 1.0 23 2.0 23 24 25 27 1.0 26 1.0 26 27 28 29 1.0 29 32 1.0 30 1.0 31 1.0 30 31 32 QST2 OF ZLJ 0 1 C 2.51351300 -0.12017800 -0.04702100 C 2.09832600 -1.23832300 -0.77449700 C 0.75635300 -1.60329900 -0.75140700 C 0.26038300 0.26394900 0.70444200 C 1.60201100 0.63345500 0.69510600 H 2.81825500 -1.79831700 -1.36272300 H 0.42510100 -2.47176400 -1.31424600 H -0.44420200 0.82287400 1.31223400 H 1.94514600 1.50143300 1.24903000 S 4.24801500 0.35760200 -0.06357800 O 4.84688900 -0.16070200 -1.30347000 O 4.32237800 1.78656800 0.28098900 C -0.19168300 -0.85059100 -0.02971000 C -1.59139700 -1.28717100 -0.00996600 H -1.76659900 -2.36221700 -0.00886300 C 4.96813000 -0.56999100 1.31518400 H 4.47901600 -0.27235500 2.24470800 H 4.84860900 -1.63946400 1.13163000 H 6.02824300 -0.30519400 1.34183000 C -2.73423100 -0.57629600 0.02839300 C -4.38269600 0.91424300 0.04656500 C -4.10075500 -1.21443800 0.22679900 O -4.29701400 -2.40632600 0.36659600 N -5.05075900 -0.19079600 0.25498000 N -4.97499500 2.13050100 -0.09204100 H -4.46329300 2.95839400 0.17990000 H -5.96076400 2.13429800 0.13576900 N -2.99876900 0.79744500 -0.08154400 C -2.16780800 1.77187100 -0.78353300 H -2.80820400 2.43733400 -1.36833000 H -1.49964400 1.24910700 -1.47120900 H -1.55713800 2.36848100 -0.09731100 1 2 1.5 5 1.5 10 1.0 2 3 1.5 6 1.0 3 7 1.0 13 1.5 4 5 1.5 8 1.0 13 1.5 5 9 1.0 6 7 8 9 10 11 2.0 12 2.0 16 1.0 11 12 13 14 1.0 14 15 1.0 20 2.0 15 16 17 1.0 18 1.0 19 1.0 17 18 19 20 22 1.0 28 1.0 21 24 2.0 25 1.5 28 1.0 22 23 2.0 24 1.0 23 24 25 26 1.0 27 1.0 26 27 28 29 1.0 29 30 1.0 31 1.0 32 1.0 30 31 32 [ Last edited by 女巫的小木屋 on 2012-4-10 at 11:19 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
全獎博士 英國利物浦大學 × 臺灣清華大學 聯(lián)合培養(yǎng)
已經有0人回復
-
尋博導
已經有13人回復
-
物理化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經有273人回復
-
基金正文30頁指的是報告正文還是整個申請書
已經有9人回復
-
誠邀有志之士加入江蘇大學環(huán)境學院合成生物學課題組！(長期接收學碩專碩、碩博連讀)
已經有16人回復
-
一志愿南大理論與計算化學方向（070300）342分，求調劑
已經有1人回復
-
歡迎化學、化工、物理、材料、或計算機背景的考研咨詢
已經有0人回復
-
哈爾濱工業(yè)大學（深圳）綠色化學團隊招收2026年秋季入學博士生
已經有11人回復
-
澳大利亞昆士蘭科技大學PhD博士獎學金
已經有0人回復
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 高斯輸出文件用什么軟件可以方便讀取
已經有14人回復
- 高斯09w做過渡金屬模擬，請教出現(xiàn)的L103錯誤如何解決，斷電中斷后這樣處理對不對
已經有3人回復
- 高斯算紫外誤差很大，咋辦？
已經有14人回復
- 高斯09中的L502出錯的問題
已經有5人回復
- 請教向量Q滿足高斯分布，用matlab如何表示？
已經有11人回復
- 有關高斯算晶體的
已經有7人回復
- 求助：origin高斯擬合
已經有10人回復
- 有個求解微分方程用到高斯賽德爾迭代的，算不太明白啊，各位幫忙看看
已經有5人回復
- 尋找過渡態(tài)一直出錯，焦頭爛額中
已經有13人回復
- 高斯計算過渡態(tài)時的能壘總是負值
已經有13人回復
- 【求助】高斯優(yōu)化過渡態(tài)出錯
已經有14人回復
- 【求助】高斯計算過渡態(tài)不收斂，請問如何解決？
已經有8人回復
zhangmt
至尊木蟲 (著名寫手)
我叫MT
- QC強帖: 5
- 應助: 99 (初中生)
- 金幣: 6961.8
- 散金: 10406
- 紅花: 49
- 帖子: 1761
- 在線: 763.2小時
- 蟲號: 880392
- 注冊: 2009-10-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學
【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數 +1
gmy1990: 金幣+3 2012-04-10 13:42:33
女巫的小木屋: 金幣+10, ★★★很有幫助 2012-04-10 14:40:31
感謝參與，應助指數 +1
gmy1990: 金幣+3 2012-04-10 13:42:33
女巫的小木屋: 金幣+10, ★★★很有幫助 2012-04-10 14:40:31
| 先不說語法錯誤，僅從你的目的來看，你想找到這個異構化的過渡態(tài)，你是否確認這是一個基元反應？你認為這可能一步完成么？直接旋轉那個雙鍵？那需要上百千卡的能壘吧。這似乎是個不可能完成的過程。因此，你用QST2直接找這個過渡態(tài)本身就是個錯誤，那么計算過程出現(xiàn)任何意外其實都是意料之中的事情。建議你大量閱讀相關文獻，多推測幾個機理，按照最可能發(fā)生的方案去做。。另外我感覺你的產物結構似乎是沒有優(yōu)化好吧。還有建議任何時候#都要改寫成#p，對你只有好處沒有壞處。你會獲得更詳細的信息。再有，只要不是分子力學模擬，請盡量刪除geom=connectivity 以及隨后的所有鏈接關系表。。。。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
女巫的小木屋
2樓2012-04-10 11:31:47
女巫的小木屋
金蟲 (正式寫手)
- 應助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 1329.9
- 散金: 47
- 紅花: 3
- 帖子: 418
- 在線: 131小時
- 蟲號: 939702
- 注冊: 2010-01-09
- 性別: MM
- 專業(yè): 藥物分析
3樓2012-04-10 14:45:19
女巫的小木屋
金蟲 (正式寫手)
- 應助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 1329.9
- 散金: 47
- 紅花: 3
- 帖子: 418
- 在線: 131小時
- 蟲號: 939702
- 注冊: 2010-01-09
- 性別: MM
- 專業(yè): 藥物分析
4樓2012-04-10 14:48:10
相關版塊跳轉
我要訂閱樓主 女巫的小木屋 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 289材料與化工（085600）B區(qū)求調劑 +3 | 這么名字咋樣 2026-03-22 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 323求調劑 +5 | 洼小桶 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南化學（0703）總分337求調劑 +9 | niko- 2026-03-19 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學 ，070300化學學碩，總分287，雙非一本，求調劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 初試 317 +7 | 半拉月丙 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 326求調劑 +5 | 諾貝爾化學獎覬?/a> 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 工科0856求調劑 +3 | 沐析汀汀 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿深大，0703化學，總分302，求調劑 +4 | 七月-七七 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 313求調劑 +4 | 肆叁貳壹22 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 307求調劑 +3 | 余意卿 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿天津大學化學工藝專業(yè)（081702）315分求調劑 +12 | yangfz 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 324分 085600材料化工求調劑 +4 | llllkkkhh 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學，080502，354分求調劑 +5 | 守候夕陽CF 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 295求調劑 +4 | 一志愿京區(qū)211 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 中南大學化學學碩337求調劑 +3 | niko- 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 295材料求調劑，一志愿武漢理工085601專碩 +5 | Charlieyq 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 086500 325 求調劑 +3 | 領帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 281求調劑（0805） +14 | 煙汐憶海 2026-03-16 | 25/1250 |
|
|
|
[考研] 一志愿中國海洋大學，生物學，301分，求調劑 +5 | 1孫悟空 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 283求調劑 +3 | 聽風就是雨； 2026-03-16 | 3/150 |
|