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鐵蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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帖子: 5
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注冊: 2011-01-05
性別: GG
專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

[求助] 求助，使用DS查看蛋白質(zhì)序列時(shí)出現(xiàn)的問題

本人最近開始學(xué)習(xí)用DS作同源模建，發(fā)現(xiàn)如下問題：
對同一個(gè)蛋白質(zhì)分子，有描述其序列的.fasta文件，用DS打開后獲得序列（1）
打開這個(gè)蛋白質(zhì)的.pdb文件，在3D窗口中查看分子中有哪些氨基酸，發(fā)現(xiàn)與序列（1）相比少了開頭的一段。
如果這時(shí)再對3D窗口中的.pdb文件使用show sequence命令，得到序列（3）
序列（3）不僅比序列（1）缺少開頭的一段，而且中間也缺少了若干段，其結(jié)果，序列（1）有230+個(gè)氨基酸，到了序列（3）只剩下170+個(gè)
這是怎么回事？是.fasta文件有誤么？

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1樓 2012-04-13 13:37:45

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

智能機(jī)器人

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