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匿名的簡(jiǎn)化字鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
求助,使用DS查看蛋白質(zhì)序列時(shí)出現(xiàn)的問(wèn)題
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本人最近開(kāi)始學(xué)習(xí)用DS作同源模建,發(fā)現(xiàn)如下問(wèn)題: 對(duì)同一個(gè)蛋白質(zhì)分子,有描述其序列的.fasta文件,用DS打開(kāi)后獲得序列(1) 打開(kāi)這個(gè)蛋白質(zhì)的.pdb文件,在3D窗口中查看分子中有哪些氨基酸,發(fā)現(xiàn)與序列(1)相比少了開(kāi)頭的一段。 如果這時(shí)再對(duì)3D窗口中的.pdb文件使用show sequence命令,得到序列(3) 序列(3)不僅比序列(1)缺少開(kāi)頭的一段,而且中間也缺少了若干段,其結(jié)果,序列(1)有230+個(gè)氨基酸,到了序列(3)只剩下170+個(gè) 這是怎么回事?是.fasta文件有誤么? |
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