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guevara1967鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[交流]
Thermo LTQ Orbitrap與QTOF的同位素豐度比 已有7人參與
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轉(zhuǎn)帖 http://msky.in/?p=67 Thermo LTQ Orbitrap的同位素豐度比不準(zhǔn) 好似聽誰說過,Orbitrap測定的同位素豐度比例不準(zhǔn)確,這是它的一個缺點。今天我也遇到了這個問題,我們用理論的同位素比例與實測的進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)差別有點大: ![]() 上圖藍(lán)線為實測數(shù)據(jù),紅線為IsoPro模擬的數(shù)據(jù)。 在網(wǎng)上檢索到兩篇文章,一篇是Agilent 6540 UHD Q-TOF與Orbitrap比較的軟文,一篇是Orbitrap的發(fā)明人Alexander Makarov發(fā)表在JASMS上好文。 Agilent的軟文認(rèn)為,隨著Orbitrap分辨率的提高,化合物的同位素峰的豐度比與理論值的偏差變大,且提高Orbitrap的掃描速度,會使某化合物的A+2同位素峰不能準(zhǔn)確測定。 ![]() 而用agilent的6540則可以很精確的測定同位素豐度比: ![]() 對于從精確質(zhì)量確定分子式來說,雖然質(zhì)量精度越高越好,但很多時候即便有0.1Da的精度,也不能確定元素組成。有文獻(xiàn)說,具有3ppm準(zhǔn)確度加2%RIA的儀器,比可以準(zhǔn)確到0.1Da但沒有同位素豐度信息的儀器,更能準(zhǔn)確確定化合物的元素組成。從這個角度說,確實6540占有一定優(yōu)勢。不過,Orbitrap的優(yōu)勢在于高分辨率,不僅在于確定化合物的元素組成,還在于當(dāng)分析復(fù)雜體系時,具有可檢測更多的能力,即便化合物的精確質(zhì)量相差10mDa,也有可能將它們分開。 Alexander介紹了高場Orbitrap的性能,下圖是Orbitrap與ICR等儀器,隨質(zhì)核比的增加,分辨率的變化情況: ![]() FTICR在小分子區(qū)域有超高的分辨率,而在分子量大于1000時,Orbitrap的分辨率優(yōu)勢就開始體現(xiàn)。高場Orbitrap和低場Orbitrap的變化趨勢,與高低場的FTICR一致,都是場強越高,分辨率越高。 “Evaluation of Accurate Mass and Relative Isotopic Abundance Measurements in the LTQ-Orbitrap Mass Spectrometer for Further Metabolomics Database Building”, http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ac100271j 該文的結(jié)論:離子的強度對化合物的relative isotope abundance (RIA)影響最大,應(yīng)該設(shè)定強度限,以使RIA的誤差<20%;FIA不如LC-MS;隨著MS分辨率的提高,RIA誤差傾向于負(fù)值,但方差統(tǒng)計不顯著;減少m/z掃描范圍可以提高RIA的測量精度;用峰高比峰面積更能提高RIA的準(zhǔn)確度. A Strategy for the Determination of the Elemental Composition by Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry Based on Isotopic Peak Ratios, http://pubs.acs.org/doi/pdfplus/10.1021/ac902931x ![]() 隨著質(zhì)譜精度的提高,候選分子式的數(shù)目大大減少。 [ Last edited by guevara1967 on 2012-4-30 at 20:14 ] |

新蟲 (小有名氣)
送鮮花一朵
謝謝分享~~~ |
木蟲 (正式寫手)
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