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guevara1967鐵桿木蟲 (著名寫手)
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Thermo LTQ Orbitrap與QTOF的同位素豐度比 已有7人參與
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轉(zhuǎn)帖 http://msky.in/?p=67 Thermo LTQ Orbitrap的同位素豐度比不準(zhǔn) 好似聽誰說過，Orbitrap測(cè)定的同位素豐度比例不準(zhǔn)確，這是它的一個(gè)缺點(diǎn)。今天我也遇到了這個(gè)問題，我們用理論的同位素比例與實(shí)測(cè)的進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)差別有點(diǎn)大：  上圖藍(lán)線為實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)，紅線為IsoPro模擬的數(shù)據(jù)。 在網(wǎng)上檢索到兩篇文章，一篇是Agilent 6540 UHD Q-TOF與Orbitrap比較的軟文，一篇是Orbitrap的發(fā)明人Alexander Makarov發(fā)表在JASMS上好文。 Agilent的軟文認(rèn)為，隨著Orbitrap分辨率的提高，化合物的同位素峰的豐度比與理論值的偏差變大，且提高Orbitrap的掃描速度，會(huì)使某化合物的A+2同位素峰不能準(zhǔn)確測(cè)定。  而用agilent的6540則可以很精確的測(cè)定同位素豐度比：  對(duì)于從精確質(zhì)量確定分子式來說，雖然質(zhì)量精度越高越好，但很多時(shí)候即便有0.1Da的精度，也不能確定元素組成。有文獻(xiàn)說，具有3ppm準(zhǔn)確度加2%RIA的儀器，比可以準(zhǔn)確到0.1Da但沒有同位素豐度信息的儀器，更能準(zhǔn)確確定化合物的元素組成。從這個(gè)角度說，確實(shí)6540占有一定優(yōu)勢(shì)。不過，Orbitrap的優(yōu)勢(shì)在于高分辨率，不僅在于確定化合物的元素組成，還在于當(dāng)分析復(fù)雜體系時(shí)，具有可檢測(cè)更多的能力，即便化合物的精確質(zhì)量相差10mDa，也有可能將它們分開。 Alexander介紹了高場(chǎng)Orbitrap的性能，下圖是Orbitrap與ICR等儀器，隨質(zhì)核比的增加，分辨率的變化情況：  FTICR在小分子區(qū)域有超高的分辨率，而在分子量大于1000時(shí)，Orbitrap的分辨率優(yōu)勢(shì)就開始體現(xiàn)。高場(chǎng)Orbitrap和低場(chǎng)Orbitrap的變化趨勢(shì)，與高低場(chǎng)的FTICR一致，都是場(chǎng)強(qiáng)越高，分辨率越高。 “Evaluation of Accurate Mass and Relative Isotopic Abundance Measurements in the LTQ-Orbitrap Mass Spectrometer for Further Metabolomics Database Building”, http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ac100271j 該文的結(jié)論：離子的強(qiáng)度對(duì)化合物的relative isotope abundance (RIA)影響最大，應(yīng)該設(shè)定強(qiáng)度限，以使RIA的誤差<20%；FIA不如LC-MS；隨著MS分辨率的提高，RIA誤差傾向于負(fù)值，但方差統(tǒng)計(jì)不顯著；減少m/z掃描范圍可以提高RIA的測(cè)量精度；用峰高比峰面積更能提高RIA的準(zhǔn)確度. A Strategy for the Determination of the Elemental Composition by Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry Based on Isotopic Peak Ratios, http://pubs.acs.org/doi/pdfplus/10.1021/ac902931x  隨著質(zhì)譜精度的提高，候選分子式的數(shù)目大大減少。 [ Last edited by guevara1967 on 2012-4-30 at 20:14 ] |
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wakan
木蟲 (正式寫手)
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4樓2012-05-02 19:42:42
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huchen
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