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幸福男人金蟲(chóng) (小有名氣)
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g09中優(yōu)化構(gòu)型的能量如何表示
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使用G09程序包，先用小基組b3lyp/6-31g(d,p)對(duì)構(gòu)型進(jìn)行優(yōu)化和頻率分析，得到的能量如下： Zero-point vibrational energy 349660.1 (Joules/Mol) 83.57077 (Kcal/Mol) Zero-point correction= 0.133179 (Hartree/Particle) Thermal correction to Energy= 0.147309 Thermal correction to Enthalpy= 0.148677 Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.081790 (用A表示) Sum of electronic and zero-point Energies= -346.650693 Sum of electronic and thermal Energies= -346.636563 Sum of electronic and thermal Enthalpies= -346.635194 Sum of electronic and thermal Free Energies= -346.702081 (用B表示) 再用大基組b3lyp/6-311+g(2df,2p)計(jì)算單點(diǎn)能： SCF Done: E(RB3LYP) = -346.895863675 （用C表示） 最后考慮到溶劑效應(yīng)： SCF Done: E(RB3LYP) = -346.904863644 （用D表示） A.U. after 12 cycles Convg = 0.5522D-08 -V/T = 2.0047 KE= 3.452718482840D+02 PE=-1.488925327817D+03 EE= 4.562252983460D+02 SMD-CDS (non-electrostatic) energy (kcal/mol) = -0.66 （用E表示） (included in total energy above) 那么優(yōu)化構(gòu)型的最終能量該如何表示呢？（由于反應(yīng)溫度為135攝氏度，想用自由能表示）我初學(xué)高斯，還請(qǐng)各位賜教。 |
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 高斯學(xué)習(xí)中的基礎(chǔ)問(wèn)題 |
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2樓2012-04-30 22:46:33
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3樓2012-05-01 06:49:06
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在小木蟲(chóng)上我看到：溶液下溶質(zhì)的總自由能= Esoln（溶液下溶質(zhì)的總能量）+Gnes（溶解增加的自由能）+deltaGcorr_gas（氣相下溶質(zhì)的熱自由能校正）。Esoln+Gnes的值在PCM計(jì)算后在log文件中作為T(mén)otal free energy in solution: with all non electrostatic terms 項(xiàng)自動(dòng)給出，而deltaGcorr_gas是在氣相下作freq計(jì)算后得到的值。注意，在這里溶液和氣相下溶質(zhì)的結(jié)構(gòu)需要分別在液相和氣相重作結(jié)構(gòu)優(yōu)化，很有可能是不一樣的。 這種方法意味著：溶液下溶質(zhì)的總自由能需要在液相重作結(jié)構(gòu)優(yōu)化，要用大基組嗎？ 如果只用氣相幾何，考慮到溶劑對(duì)吉布斯自由能的校正，該如何計(jì)算溶液下溶質(zhì)的總自由能呢？ |
4樓2012-05-01 08:32:43
richen0564
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5樓2012-05-03 12:26:12
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樓主現(xiàn)在應(yīng)該明白了吧、我現(xiàn)在寫(xiě)文章也在這個(gè)問(wèn)題上很困擾、請(qǐng)問(wèn)最后的吉布斯自由能該如何表示?是不是大基組計(jì)算單點(diǎn)能+Thermal correction to Gibbs Free Energy? 
6樓2012-09-04 09:47:28
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7樓2012-09-05 05:40:19
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8樓2012-09-10 08:35:44
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