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sesy木蟲 (小有名氣)
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[求助]
請(qǐng)教高斯09算溶劑效應(yīng)及能量校正問題，多送金幣+小紅花
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我們這級(jí)新接觸Gaussion09,看小木蟲中有很多帖子說09和03做能量校正得到的輸出結(jié)果不一樣， 所以請(qǐng)教高手看看我用09算的方法對(duì)不對(duì)，尤其是輸入文件寫的有問題嗎？我先優(yōu)化完結(jié)構(gòu)然后做單點(diǎn)能和溶劑效應(yīng)，輸入文件如下，請(qǐng)之前用過09的蟲友們多多指點(diǎn)。 多送金幣+小紅花 希望大家多多關(guān)注，急求解答！��！一、使用G09程序包，先用小基組b3lyp/6-31g(d)對(duì)構(gòu)型進(jìn)行優(yōu)化和頻率分析， 輸入文件關(guān)鍵詞 ：# opt freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity 輸出結(jié)果選用的 Thermal correction to Gibbs Free Energy= (用A表示) 二、再用大基組計(jì)算單點(diǎn)能：# b3lyp/6-311++g(d,p) scf=tight 輸出結(jié)果選用的 SCF Done: E(RB3LYP) = -1246.14645414（用B表示） 三、最后考慮到溶劑效應(yīng)： 輸入文件# b3lyp/6-311++g(d,p) scf=tight scrf=(PCM,solvent=benzene,read,smd,Dovacuum,ExternalIteration) 。 。 。 Radii=uaks （最后） 輸出結(jié)果選用的 DeltaG (solv) (kcal/mol) = -38.40 （用C表示） 最后自由能表示：自由能=自由能校正（A）+單點(diǎn)能（B）+溶劑化能（C） 請(qǐng)大家看看我這樣做對(duì)不對(duì)，還有不對(duì)的話應(yīng)該怎樣寫輸入文件？多謝大家。。。 |
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sesy: 金幣+20, ★★★很有幫助, 非常感謝 2012-10-12 16:44:52
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一、使用G09程序包，先用小基組b3lyp/6-31g(d)對(duì)構(gòu)型進(jìn)行優(yōu)化和頻率分析， 輸入文件關(guān)鍵詞 ：# opt freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity 輸出結(jié)果選用的 Thermal correction to Gibbs Free Energy= (用A表示) 二、輸入文件# b3lyp/6-311++g(d,p) scf=tight scrf=(solvent=benzene,read,smd,Dovacuum) 。 。 。 Radii=uaks （最后） 輸出結(jié)果選用的 DeltaG (solv) (kcal/mol) = -38.40 （用C表示） 最后自由能表示：自由能=自由能校正（A）+(C） |
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12樓2012-10-12 07:50:36
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14樓2012-10-12 16:18:12
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趕緊來幫幫忙吧。。。。只是幫偶看一下這樣做對(duì)不對(duì)？我有將近100個(gè)結(jié)構(gòu)，已經(jīng)算了一半了。。。急求解答 金幣全送您、、、 4樓2012-10-11 14:41:21
sesy
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6樓2012-10-11 18:00:34
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sesy: 金幣+10, ★★★很有幫助, O(∩_∩)O謝謝 2012-10-11 19:52:36
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第二步 二、再用大基組計(jì)算單點(diǎn)能：# b3lyp/6-311++g(d,p) scf=tight 輸出結(jié)果選用的 SCF Done: E(RB3LYP) = -1246.14645414（用B表示） 是沒有必要算的，只算一三步就行。 最后自由能表示：自由能=自由能校正（A）+溶劑化下的單點(diǎn)能 溶劑化下的單點(diǎn)能是g09溶劑化輸出結(jié)果中的SCF Done: E(UB3LYP) = 這一項(xiàng)的能量 |
7樓2012-10-11 18:35:42
luyating2005
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sesy
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9樓2012-10-11 20:02:33
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