jixiao0526

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[求助] 計(jì)算neb出錯(cuò)，請(qǐng)高手幫忙看看

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1樓 2012-05-01 16:29:30

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這是任務(wù)提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/mpich2-1.3.1/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $np /home/dftsoft/vasp_build/vasp.5.2/vasp_gobals_ifort

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2樓2012-05-01 16:36:38

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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
WDD880227: 金幣+2, 感謝您的細(xì)心解答 2012-05-02 18:39:01

引用回帖:

2樓: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-01 16:36:38:
這是任務(wù)提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/ ...

兩個(gè)問(wèn)題，第一你的INCAR不存在
第二你在INCAR中沒(méi)有設(shè)置IMAGES=這個(gè)值

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3樓2012-05-02 09:40:32

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引用回帖:

3樓: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 09:40:32:
兩個(gè)問(wèn)題，第一你的INCAR不存在
第二你在INCAR中沒(méi)有設(shè)置IMAGES=這個(gè)值

兩個(gè)問(wèn)題都不是…

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4樓2012-05-02 10:25:45

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WDD880227: 金幣+1, 感謝交流提示 2012-05-02 18:39:29

引用回帖:

4樓: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-02 10:25:45:
兩個(gè)問(wèn)題都不是…

把你的INCAR拿上來(lái)，再一個(gè)檢查你INCAR的權(quán)限，是不是權(quán)限太高執(zhí)行不了。試試把INCAR權(quán)限調(diào)低些

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5樓2012-05-02 10:50:55

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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
WDD880227: 金幣+1, 感謝交流提示 2012-05-02 18:39:44

IMAGES=這個(gè)值設(shè)置有誤，建議再看一下先關(guān)VASP資料。

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我的人生注定了有你陪伴，我們的生活會(huì)越來(lái)越美好，加油！

6樓2012-05-02 15:58:07

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★
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2012-05-04 08:49:52

對(duì)了，應(yīng)該是INCAR中設(shè)置插點(diǎn)的個(gè)數(shù)有問(wèn)題，和實(shí)際產(chǎn)生的文件數(shù)不一致，要么就是你的核心數(shù)不能平均到每個(gè)插點(diǎn)上，比如，8個(gè)核的如果插點(diǎn)數(shù)為3的話就會(huì)出問(wèn)題。

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7樓2012-05-02 16:01:26

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5樓: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 10:50:55:
把你的INCAR拿上來(lái)，再一個(gè)檢查你INCAR的權(quán)限，是不是權(quán)限太高執(zhí)行不了。試試把INCAR權(quán)限調(diào)低些

怎么看incar的權(quán)限，怎么調(diào)整？

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8樓2012-05-02 17:51:29

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6樓: Originally posted by 亞楠 at 2012-05-02 15:58:07:
IMAGES=這個(gè)值設(shè)置有誤，建議再看一下先關(guān)VASP資料。

我設(shè)置的是8啊，用的八個(gè)節(jié)點(diǎn)。8N不是嗎？

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9樓2012-05-02 17:52:19

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7樓: Originally posted by 亞楠 at 2012-05-02 16:01:26:
對(duì)了，應(yīng)該是INCAR中設(shè)置插點(diǎn)的個(gè)數(shù)有問(wèn)題，和實(shí)際產(chǎn)生的文件數(shù)不一致，要么就是你的核心數(shù)不能平均到每個(gè)插點(diǎn)上，比如，8個(gè)核的如果插點(diǎn)數(shù)為3的話就會(huì)出問(wèn)題。

我用的是8個(gè)節(jié)點(diǎn)，每個(gè)節(jié)點(diǎn)4核

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10樓2012-05-02 17:53:01

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