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396101466金蟲 (正式寫手)
一段遺失的美好
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[求助]
有關(guān)PDB數(shù)據(jù)庫的使用問題
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最近做一個關(guān)于蛋白質(zhì)3D結(jié)構(gòu)相關(guān)的實驗，涉及到蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象，以及蛋白質(zhì)在實驗過程中的相關(guān)變化，所以要用到PDB數(shù)據(jù)庫里面的蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)。有做相關(guān)的大俠，可進來交流一下。 1.首先，我想問問，我只是知道蛋白質(zhì)的名稱，不知道蛋白質(zhì)的檢索ID怎么去檢索其相應(yīng)的3D結(jié)構(gòu)？ 2.PDB數(shù)據(jù)庫有木有收錄同種蛋白質(zhì)的不同的聚體形式，比喻單體和二聚體的3D結(jié)構(gòu)？如果有這樣的，；請問你怎么檢索？ 3.能檢索到相關(guān)3D結(jié)構(gòu)的是蛋白是不是都是改蛋白在結(jié)晶狀態(tài)下的3D結(jié)構(gòu)？ 期待和給位大俠們交流！ |
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| 進入PDB數(shù)據(jù)庫網(wǎng)頁：http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do 輸入蛋白質(zhì)名稱，對于一種蛋白可能有很多種晶體結(jié)構(gòu)，收錄到PDB數(shù)據(jù)庫，這個你可以根據(jù)它們的描述去選擇你需要的晶體圖，下載它們PDB格式的圖即可，這些圖需要相應(yīng)的軟件才可以打開，如：pyMOL |
5樓2012-05-04 22:17:59
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6樓2012-05-05 08:36:37
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