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小木蟲論壇-學(xué)術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » 3個基本問題求助
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[求助]
3個基本問題求助
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小弟正在模擬二氧化硅地層吸水，現(xiàn)在已經(jīng)加入kcl來抑制地層吸水，從而保持井壁穩(wěn)定：如圖下面為二氧化硅地層Pd（001）為了使其吸水效果明顯，表面已經(jīng)羥基化，上面紅白為水分子，藍(lán)色為鉀離子，白色為氯離子。小弟現(xiàn)在有下面幾個問題，希望各位老師和高手解答： 1加入氯化鉀是離子化合物，他們之間的化學(xué)鍵是不是應(yīng)該改為Break Bond？才能使各自帶有電荷。 2一共兩個模型，第一是二氧化硅純吸水的模擬，第二是加入氯化鉀后的模擬，希望老師解答：該從什么參數(shù)（比如說吸附等等）來評價氯化鉀的作用？ 3現(xiàn)在加了60個水分子，10個氯化鉀分子，請問那個密度Density（如下圖）怎么算呢？ 小弟感激不盡，謝謝各位老師。 模型 最下面的密度 |
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 MS 吸附模擬 |
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2樓2012-05-05 01:31:16
3樓2012-05-08 20:07:29
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金蟲 (小有名氣)
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chaizhm: 金幣+5, 謝謝~ 2012-05-08 22:34:42
hjfdgg: 金幣+30, ★★★★★最佳答案 2012-05-09 21:13:21
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感覺是要用discovery模塊跑動力學(xué)吧 1. 加離子是離子鍵，它們之間沒有鍵參數(shù)，只有VDW和庫侖作用。再往固體表面粘貼這些離子的時候CL和Na是分開的，粘貼前如果不賦值電荷，而在計算的時候采用力場電荷，是在能量最小化之后就查看電荷是否分別為-1和1. 2.我覺得可以從二氧化硅表面的那個Si-O-H基團(tuán)的周圍水的RDF分布，以及它們周圍氫鍵的分析，比如HB平均個數(shù)，時間自相關(guān)函數(shù)等來查看鹽對潤濕性的影響。這種影響可能是由于離子與Si-o-h結(jié)合改變水合作用引起。 3.是用分析工具里的concentration profiles來做的。如果計算格子不是立方格子，好像需要forcite的分析工具才可以算。 |
4樓2012-05-08 22:30:02
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