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新蟲 (初入文壇)

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[求助] 分子優(yōu)化疊合

請教各位大神，我的課題是甲基喹啉酮乙酸類化合物的3D-QSAR研究。
我用sybyl畫好結(jié)構(gòu)圖后，要進行分子優(yōu)化，但是不知道怎么加上電荷，也不清楚怎么進行分子疊合，求詳細的sybyl 操作流程。是不是要把分子放在一個數(shù)據(jù)庫內(nèi)才可以進行疊合？？求解答，謝謝各位了

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1樓 2012-05-05 13:53:54

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ky96998

金蟲 (小有名氣)

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chaizhm: 金幣+3, 很同意你的觀點，這種人得好好教育 2012-05-10 11:02:27

典型的不看sybyl操作手冊類問題
你的問題都是sybyl最基礎(chǔ)的操作問題，說明書上都有具體操作指導(dǎo)，建議自己看操作手冊。你所研究的分子集是需要放入一個數(shù)據(jù)庫的，這樣方便操作。用MSS打開數(shù)據(jù)庫，compute里面就可以優(yōu)化分子，加電荷。不過你做的是3D-QSAR研究，一般的能量優(yōu)化后的構(gòu)象和活性構(gòu)象差別可能很大，如果有受體信息，建議基于分子對接來做QSAR

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