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huangll99木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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[交流]
【已完結(jié)】如何計(jì)算macroscopic average
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Siesta中有一個(gè)很好的tool-->macroave,可以用來(lái)計(jì)算一些與表面和界面相關(guān)的物理量。主要就是計(jì)算planar average 和 macroscopic average。 由于我對(duì)Siesta完全不懂，想要請(qǐng)教一下各位，Siesta中保存電荷密度和靜電勢(shì)的文件的格式是怎樣的，如何把VASP中的CHGCAR 和 LOCPOT 的格式轉(zhuǎn)換成Siesta中的格式，然后借助macroave這個(gè)工具來(lái)做分析 弄好了  [ Last edited by huangll99 on 2012-5-14 at 16:56 ] |
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2012-05-13 09:21:19, 21.24 K
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2樓2012-05-13 09:20:47
huangll99
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沒(méi)人理，自己頂一頂 把LOCPOT 轉(zhuǎn)換成PWscf中可以讀的格式，然后借助average.f90這個(gè)小工具來(lái)處理有沒(méi)有可行性呢，  請(qǐng)goldenfisher專(zhuān)家來(lái)幫幫忙 @goldenfisher [ Last edited by huangll99 on 2012-5-14 at 08:27 ] |
3樓2012-05-14 08:15:20
goldenfisher
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4樓2012-05-14 11:56:28
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5樓2012-05-14 12:26:09
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哇哈哈，PWscf中的average.f90果然可以，就是不知道PWscf中的靜電勢(shì)文件里的這些內(nèi)容是什么意思 15 15 144 15 15 144 4 1 6 5.42350901 0.00000000 6.36396103 0.00000000 0.00000000 0.00000000 44.7046033528 4.0000000000 15.0000000000 11 1 Al 3.00 1 0.000000000 0.000000000 4.242640687 1 2 0.500000000 0.500000000 3.535533906 1 3 0.000000000 0.000000000 2.828427125 1 4 0.500000000 0.500000000 2.121320344 1 傳一張效果圖  俺一個(gè)人自言自語(yǔ)，版主可不要給偶刪帖啊  [ Last edited by huangll99 on 2012-5-14 at 13:09 ] |
6樓2012-05-14 13:03:44
goldenfisher
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我不太明白你說(shuō)的靜電勢(shì)在這里為何意？ 存儲(chǔ)電荷密度的文件就是pp.x計(jì)算后產(chǎn)生的.charge文件，就是pp.x計(jì)算的輸入文件中命名的那個(gè)文件。 上面的意思就是什么格點(diǎn)數(shù)目啊，晶格常數(shù)啊，等等，這些基本的意思。 |
7樓2012-05-14 14:25:22
huangll99
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8樓2012-05-14 14:40:13
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看來(lái)LZ不喜歡多文件對(duì)比哦～其實(shí)查文件內(nèi)容的規(guī)律是很有意思的一件事的。 檢查Al.scf.in，可以看到，ibrav = 6，并且 事實(shí)上，PWscf的celldm(i)有6個(gè)，不需要標(biāo)明的是根據(jù)ibrav計(jì)算的，所以把ibrav和celldm(i)全列出來(lái)，就是： 至于第一列，注意Al.scf.out中： 以及Al.scf.in中： 所以推測(cè)前面六個(gè)數(shù)字15 15 144 15 15 144分別是：nr1 nr2 nr3 nr1s nr2s nr3s（對(duì)FFT不熟悉，所以不保證推測(cè)正確） 第一列最后的4 1應(yīng)該是四個(gè)原子，一種元素的意思。 |
9樓2012-05-15 17:01:35
huangll99
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LZ，能傳我一個(gè)計(jì)算macroscopic average potential的程序么？ 郵箱：vinberg.lee@mail.dlut.edu.cn 謝謝先～ |
15樓2014-04-24 18:46:07
16樓2016-05-30 14:48:54
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