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lijunjiexm鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
請(qǐng)教關(guān)于帶約束的分子模擬程序SHAKE代碼問(wèn)題，謝謝
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請(qǐng)問(wèn)哪里有公開(kāi)的SHAKE代碼？ SHAKE指的是帶約束的分子動(dòng)力學(xué)模擬，或者帶約束的布朗動(dòng)力學(xué)(BD)模擬, 請(qǐng)多多指教，謝謝 附：最早SHAKE的文獻(xiàn)是 JEAN-PAUL RYCKAERT, GIOVANNI CICCOTTI， Numerical integration of the Cartesian Equations of Motion of a System with Constraints: Molecular Dynamics of n-Alkanes，JOURNAL OF COMPUTATIONAL. PHYSICS 23, 321-341 (1977) [ Last edited by lijunjiexm on 2012-5-13 at 13:30 ] |
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3樓2015-02-04 21:08:39
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zh1987hs: 金幣+3, 謝謝 2012-05-13 18:07:05
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zh1987hs: 金幣+3, 謝謝 2012-05-13 18:07:05
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先讓我崇拜一下自己寫代碼的牛人！ 公開(kāi)的SHAKE代碼，應(yīng)該lammps ，gromacs 源代碼里面都有吧，推薦你查看一下lammps 的源代碼，朗動(dòng)力學(xué)在lammps里也有，而lammps就是公開(kāi)源代碼的，你可以在他們的基礎(chǔ)上來(lái)學(xué)習(xí)修改。 http://lammps.sandia.gov/ |
2樓2012-05-13 15:58:01
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