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[求助]
MS建盒子，放入溶質(zhì)，如何再空隙處添加水分子？
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| 請(qǐng)問用MS建了box，把溶質(zhì)分子加進(jìn)去了，這時(shí)候怎么在空余的地方添加水分子？因?yàn)槲倚枰约褐付ㄈ苜|(zhì)分子在box中的明確位置，不能讓它自己隨意的安置。請(qǐng)高手給予詳細(xì)的說明，不勝感激！ |
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andong1988
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5樓2012-06-05 12:39:49
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| 遇到這種情況，我采用gromacs里的genbox程序。輸出MS所建構(gòu)型的pdb文件，然后使用gromacs中的命令 genbox -cp ***.pdb -cs spc216.gro -o out.pdb. 再把out.pdb用MS打開 |
4樓2012-06-01 18:45:20
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