【獎(jiǎng)勵(lì)】本帖被評(píng)價(jià)67次，作者zhangguangping增加金幣 53 個(gè)

本帖產(chǎn)生 1 個(gè) 1ST強(qiáng)帖，點(diǎn)擊這里進(jìn)行查看

當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖

zhangguangping

木蟲 (著名寫手)

[資源] ifort(10.1.012) + MKL(10.0.2.018) + OpenMPI(1.4.4)編譯并行vasp-5.2.2

ifort,MKL以及OpenMPI的安裝不多贅述,可以參考
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1930406
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4433857

0.編譯MKL中的fftw 3.x Fortran wrapper library
cd /opt/intel/mkl/10.1.0.015/interfaces/fftw3xf
make libem64t compiler=intel
如果沒有安裝icc的話,需要使用gcc,則
make libem64t compiler=gnu

1.解壓vasp軟件包
tar zxvf vasp.5.2.tar.gz
tar zxvf vasp.5.lib.tar.gz

2. 編譯 VASP帶的lib得到libdmy.a

cd vasp.5.lib
cp makefile.linux_ifc_P4 makefile
vi makefile
修改
FC=ifort
make

3.編譯vasp
cd vasp.5.2
cp makefile.linux_ifc_P4 makefile
修改整個(gè)文件如附件
主要要修改的地方如下：(一定注意將重復(fù)的部分去掉,因?yàn)檫@個(gè)makefile的模版比較雜亂,可以直接用附件的文件根據(jù)自己情況修改)
FC=mpif90
FCL=$(FC)

CPP_ =  ./preprocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX)

CPP = $(CPP_) -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \
   -Dkind8 -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \
   -DMPI_BLOCK=8000 \
   -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV  -DscaLAPACK

FFLAGS =  -I/opt/intel/mkl/10.0.2.018/include/fftw -FR -lower_case

OFLAG=-O3

OFLAG_HIGH = $(OFLAG)
OBJ_HIGH =
OBJ_NOOPT =
DEBUG  = -FR -O0
INLINE = $(OFLAG)

BLAS= -L/opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread

LAPACK= -L/opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_intel_lp64  -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread

SCA= /opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t/libmkl_scalapack_lp64.a /opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a

LIB    = -L../vasp.5.lib -ldmy  \
   ../vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \
   $(SCA) $(BLAS)

FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o  /opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t/libfftw3xf_intel.a

編譯完畢.
make ~/bin
cp vasp ~/bin

測(cè)試：（測(cè)試文件見附件）
mpirun -np 8 ~/bin/vasp >vasp.out &[ Last edited by zhangguangping on 2012-6-6 at 21:33 ]

需要注意的是在編譯intel的fftw3xf的時(shí)候，雖然有兩種方法:
make libem64t compiler=intel
和
make libem64t compiler=gnu，
如果你沒有icc，也不要使用gnu的這個(gè)命令，因?yàn)榫幾g到最后會(huì)報(bào)如下錯(cuò)誤：
fftw3d.o: In function `fftmakeplan_': 。。。等等
這個(gè)時(shí)候需要的是修改makefile為：
ifeq ($(compiler),gnu)
override CC=gcc -D_GNU
else
override compiler=intel
override CC=gcc
endif

或者把gnu下面的gcc的參數(shù)去掉：
ifeq ($(compiler),gnu)
override CC=gcc
else
override compiler=intel
override CC=icc
endif

這樣的話，make libem64t compiler=gnu編譯也是可以的。
也就是說即使指明用intel,也要用gcc編譯。這樣生成的文件大小和用gnu大小都是不一樣的。

[ Last edited by zhangguangping on 2014-1-11 at 12:11 ]

vasp 5.3.2編譯時(shí)不能直接用vasp 5.2的makefile.附件中上傳了5.3.2的makefile.其中，
FC=mpif90 -I/home/software/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/include/fftw中的-I/home/software/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/include/fftw是為了編譯fftmpiw.F時(shí)用的。因?yàn)榫幾gfftmpiw.F的規(guī)則是
fftmpiw.o : fftmpiw.F
      $(CPP)
      $(FC) -FR -lowercase -O1 $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
或者將/home/software/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/include/fftw目錄下的fftw3.f文件拷貝到當(dāng)下編譯目錄中也可以。[ Last edited by zhangguangping on 2014-12-11 at 07:19 ]

回復(fù)此樓

» 本帖附件資源列表

歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺(tái)，不對(duì)該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對(duì)版權(quán)有異議，請(qǐng)聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com
附件 1 : lib-makefile

2012-06-06 20:49:29, 1.78 K

附件 2 : 1_7_H2O.rar

2012-06-06 20:53:41, 87.86 K

附件 3 : vasp-makefile

2012-06-06 21:33:27, 6.3 K

附件 4 : makefile-5.3.2

2014-12-11 07:16:30, 6.44 K

» 收錄本帖的淘帖專輯推薦

» 猜你喜歡

309求調(diào)劑已經(jīng)有8人回復(fù)
一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷已經(jīng)有8人回復(fù)
求調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)
求化學(xué)調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)
085600，材料與化工321分求調(diào)劑已經(jīng)有10人回復(fù)
0703 化學(xué) 求調(diào)劑，一志愿山東大學(xué) 342 分已經(jīng)有5人回復(fù)
一志愿南開大學(xué)0710生物學(xué)359求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
085600，專業(yè)課化工原理，320分求調(diào)劑已經(jīng)有4人回復(fù)
材料與化工272求調(diào)劑已經(jīng)有16人回復(fù)
290求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

vasp-mkl和vasp-vtst都是什么意思已經(jīng)有4人回復(fù)
VASP5.2版本并行安裝時(shí)出問題了，已經(jīng)到最后一步了已經(jīng)有28人回復(fù)
緊急求助---VASP.5.2編譯已經(jīng)有16人回復(fù)
vasp.5.2編譯出錯(cuò)，跪求解決辦法！已經(jīng)有10人回復(fù)
AIX系統(tǒng)編譯介紹及VASP編譯已經(jīng)有5人回復(fù)
編譯問題，急求~~~ 已經(jīng)有4人回復(fù)
【已解決】VASP內(nèi)存占用瘋漲……看來得重新編譯了…… 已經(jīng)有14人回復(fù)
openmpi安裝問題已經(jīng)有17人回復(fù)
編譯vasp主程序時(shí)，makefile中的鏈接庫選擇問題已經(jīng)有15人回復(fù)
vasp5.2 openmpi+intel+mkl編譯，能量正值問題已經(jīng)有7人回復(fù)
Dalton2011并行編譯詳記已經(jīng)有33人回復(fù)
如何用pathscale + openmpi 編譯Abinit？已經(jīng)有7人回復(fù)

1樓 2012-06-06 20:59:33

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

樂石||

木蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 26 (小學(xué)生)
金幣: 2416.4
帖子: 977
在線: 807.5小時(shí)
蟲號(hào): 1474843

★★★★★ 五星級(jí),優(yōu)秀推薦

最好不要用ifort(10.1.012)編譯，用11會(huì)好些

贊一下

回復(fù)此樓

3樓2012-06-06 21:12:01

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

查看全部 86 個(gè)回答

fzx2008

榮譽(yù)版主 (著名寫手)

★★★★★ 五星級(jí),優(yōu)秀推薦

guangping兄辛苦了！

贊一下

回復(fù)此樓

2樓2012-06-06 21:06:26

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

zhangguangping

木蟲 (著名寫手)

引用回帖:

3樓: Originally posted by 樂石|| at 2012-06-06 21:12:01
最好不要用ifort(10.1.012)編譯，用11會(huì)好些

這個(gè)版本的編譯存在什么已知的問題呢？請(qǐng)指教！

贊一下

回復(fù)此樓

4樓2012-06-06 21:34:28

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

雁兒霏霏

木蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 2 (幼兒園)
金幣: 2645.4
帖子: 883
在線: 160.1小時(shí)
蟲號(hào): 934537

★★★★★ 五星級(jí),優(yōu)秀推薦

哈哈，開始研究vasp了？

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2012-06-06 21:35:40

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

簡(jiǎn)單回復(fù)

mansamsung811312樓

2012-06-07 13:51 回復(fù)

五星好評(píng) 頂一下，感謝分享！

lwk20513樓

2012-06-09 18:36 回復(fù)

五星好評(píng) 頂一下，感謝分享！

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]	作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 求調(diào)劑 +5	家佳佳佳佳佳 2026-03-29	5/250	2026-03-29 23:53 by yokiii1
[考研] 311求調(diào)劑 +6	冬十三 2026-03-24	6/300	2026-03-29 20:45 by 無際的草原
[考研] 291求調(diào)劑 +5	Y-cap 2026-03-29	6/300	2026-03-29 13:18 by mumin1990
[考研] 求收留 +5	1943443204 2026-03-28	5/250	2026-03-29 12:11 by 無際的草原
[考研] 調(diào)劑求院校招收 +6	鶴鯨鴿 2026-03-28	6/300	2026-03-29 08:15 by fmesaito
[考研] 330分求調(diào)劑 +5	qzenlc 2026-03-29	5/250	2026-03-29 07:37 by 無際的草原
[考研] 316求調(diào)劑 +7	江辭666 2026-03-26	7/350	2026-03-28 21:28 by sanrepian
[考研] 本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動(dòng)285求調(diào)劑 +3	AZMK 2026-03-27	5/250	2026-03-28 16:19 by xxxsssccc
[考研] 材料277求調(diào)劑 +7	min3 2026-03-24	7/350	2026-03-28 11:39 by xuxiang
[考研] 308求調(diào)劑 +7	墨墨漠 2026-03-27	7/350	2026-03-28 07:43 by 熱情沙漠
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑，各位老師看看我�。�！ +5	祁祺祺 2026-03-25	5/250	2026-03-27 21:44 by 東方豬豬
[考研] 070300化學(xué)求調(diào)劑 +4	起個(gè)名咋這么難 2026-03-27	4/200	2026-03-27 21:39 by 83503孫老師
[考研] 333求調(diào)劑 +3	question挽風(fēng) 2026-03-23	3/150	2026-03-27 11:29 by 不吃魚的貓
[考研] 求調(diào)劑323材料與化工 +7	1124361 2026-03-24	7/350	2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 求調(diào)劑，一志愿南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩 +4	@taotao 2026-03-26	5/250	2026-03-27 08:10 by hypershenger
[考研] 303求調(diào)劑 +6	藍(lán)山月 2026-03-25	6/300	2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 334分一志愿武理-080500 材料求調(diào)劑 +4	李李不服輸 2026-03-25	4/200	2026-03-25 21:26 by 星空星月
[考研] 347求調(diào)劑 +4	L when 2026-03-25	4/200	2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 一志愿北化315 求調(diào)劑 +3	akrrain 2026-03-24	3/150	2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 277分求調(diào)劑，跨調(diào)材料 +3	考研調(diào)劑lxh 2026-03-24	3/150	2026-03-24 13:52 by JourneyLucky