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zhangguangping

木蟲 (著名寫手)

[資源] ifort(10.1.012) + MKL(10.0.2.018) + OpenMPI(1.4.4)編譯并行vasp-5.2.2

ifort,MKL以及OpenMPI的安裝不多贅述,可以參考
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1930406
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4433857

0.編譯MKL中的fftw 3.x Fortran wrapper library
cd /opt/intel/mkl/10.1.0.015/interfaces/fftw3xf
make libem64t compiler=intel
如果沒有安裝icc的話,需要使用gcc,則
make libem64t compiler=gnu

1.解壓vasp軟件包
tar zxvf vasp.5.2.tar.gz
tar zxvf vasp.5.lib.tar.gz

2. 編譯 VASP帶的lib得到libdmy.a

cd vasp.5.lib
cp makefile.linux_ifc_P4 makefile
vi makefile
修改
FC=ifort
make

3.編譯vasp
cd vasp.5.2
cp makefile.linux_ifc_P4 makefile
修改整個(gè)文件如附件
主要要修改的地方如下：(一定注意將重復(fù)的部分去掉,因?yàn)檫@個(gè)makefile的模版比較雜亂,可以直接用附件的文件根據(jù)自己情況修改)
FC=mpif90
FCL=$(FC)

CPP_ =  ./preprocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX)

CPP = $(CPP_) -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \
   -Dkind8 -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \
   -DMPI_BLOCK=8000 \
   -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV  -DscaLAPACK

FFLAGS =  -I/opt/intel/mkl/10.0.2.018/include/fftw -FR -lower_case

OFLAG=-O3

OFLAG_HIGH = $(OFLAG)
OBJ_HIGH =
OBJ_NOOPT =
DEBUG  = -FR -O0
INLINE = $(OFLAG)

BLAS= -L/opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread

LAPACK= -L/opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_intel_lp64  -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread

SCA= /opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t/libmkl_scalapack_lp64.a /opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a

LIB    = -L../vasp.5.lib -ldmy  \
   ../vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \
   $(SCA) $(BLAS)

FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o  /opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t/libfftw3xf_intel.a

編譯完畢.
make ~/bin
cp vasp ~/bin

測試：（測試文件見附件）
mpirun -np 8 ~/bin/vasp >vasp.out &[ Last edited by zhangguangping on 2012-6-6 at 21:33 ]

需要注意的是在編譯intel的fftw3xf的時(shí)候，雖然有兩種方法:
make libem64t compiler=intel
和
make libem64t compiler=gnu，
如果你沒有icc，也不要使用gnu的這個(gè)命令，因?yàn)榫幾g到最后會(huì)報(bào)如下錯(cuò)誤：
fftw3d.o: In function `fftmakeplan_': 。。。等等
這個(gè)時(shí)候需要的是修改makefile為：
ifeq ($(compiler),gnu)
override CC=gcc -D_GNU
else
override compiler=intel
override CC=gcc
endif

或者把gnu下面的gcc的參數(shù)去掉：
ifeq ($(compiler),gnu)
override CC=gcc
else
override compiler=intel
override CC=icc
endif

這樣的話，make libem64t compiler=gnu編譯也是可以的。
也就是說即使指明用intel,也要用gcc編譯。這樣生成的文件大小和用gnu大小都是不一樣的。

[ Last edited by zhangguangping on 2014-1-11 at 12:11 ]

vasp 5.3.2編譯時(shí)不能直接用vasp 5.2的makefile.附件中上傳了5.3.2的makefile.其中，
FC=mpif90 -I/home/software/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/include/fftw中的-I/home/software/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/include/fftw是為了編譯fftmpiw.F時(shí)用的。因?yàn)榫幾gfftmpiw.F的規(guī)則是
fftmpiw.o : fftmpiw.F
      $(CPP)
      $(FC) -FR -lowercase -O1 $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
或者將/home/software/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/include/fftw目錄下的fftw3.f文件拷貝到當(dāng)下編譯目錄中也可以。[ Last edited by zhangguangping on 2014-12-11 at 07:19 ]

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附件 1 : lib-makefile

2012-06-06 20:49:29, 1.78 K

附件 2 : 1_7_H2O.rar

2012-06-06 20:53:41, 87.86 K

附件 3 : vasp-makefile

2012-06-06 21:33:27, 6.3 K

附件 4 : makefile-5.3.2

2014-12-11 07:16:30, 6.44 K

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1樓 2012-06-06 20:59:33

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zhangguangping

木蟲 (著名寫手)

引用回帖:

3樓: Originally posted by 樂石|| at 2012-06-06 21:12:01
最好不要用ifort(10.1.012)編譯，用11會(huì)好些

這個(gè)版本的編譯存在什么已知的問題呢？請指教！

贊一下

回復(fù)此樓

4樓2012-06-06 21:34:28

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

查看全部 86 個(gè)回答

fzx2008

榮譽(yù)版主 (著名寫手)

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guangping兄辛苦了！

贊一下

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2樓2012-06-06 21:06:26

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樂石||

木蟲 (正式寫手)

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最好不要用ifort(10.1.012)編譯，用11會(huì)好些

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3樓2012-06-06 21:12:01

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雁兒霏霏

木蟲 (正式寫手)

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哈哈，開始研究vasp了？

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5樓2012-06-06 21:35:40

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簡單回復(fù)

mansamsung811312樓

2012-06-07 13:51 回復(fù)

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lwk20513樓

2012-06-09 18:36 回復(fù)

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