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gaussian08銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
Amber做小分子初始結(jié)構(gòu)生成
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各位大俠： 我做一個疏水性表面結(jié)構(gòu)，用packmol生成了一個包含兩種物質(zhì)（a和b）的box.pdb， a和b的參數(shù)文件a.frcmod和b.frcmod 以及結(jié)構(gòu)文件a.prep 和b.prep 都正確， 我分布用a和b分別生成amber的拓撲和坐標文件prmtop 和inpcrd都沒有問題，但是當我分別load參數(shù)和結(jié)構(gòu)后，生成一個包含兩種物質(zhì)的一個統(tǒng)一的拓撲和坐標文件，就是報錯，哪位大俠能幫助小弟一下，不勝感激！ |
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