版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

登錄注冊

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號能夠正常使用，請盡快對帳號進(jìn)行手機(jī)號驗證，感謝您的理解與支持！

24小時熱門版塊排行榜

返回列表

hustzju

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 12 (小學(xué)生)
金幣: 4132.6
散金: 2166
紅花: 12
帖子: 1256
在線: 259.3小時
蟲號: 617660
注冊: 2008-10-05
性別: GG
專業(yè): 有機(jī)分析

[求助] 有坐標(biāo)怎么看結(jié)構(gòu)��？

只有優(yōu)化后的坐標(biāo)，supporting information里只給了坐標(biāo)，
怎么能看到結(jié)構(gòu)？

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

請問四氫呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀時，如何使沉淀過程加速？已經(jīng)有2人回復(fù)
量子點電致發(fā)光器件（QLED）：藍(lán)光量子點（QDs）和納米氧化鋅電子傳輸材料已經(jīng)有0人回復(fù)
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)? 已經(jīng)有95人回復(fù)
需要一個圓偏振光誘導(dǎo)化學(xué)反應(yīng)，請問使用圓偏振光作為光源，應(yīng)該需要哪些設(shè)備搭建已經(jīng)有0人回復(fù)
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最經(jīng)典的一本表面上化學(xué)相互作用教材已經(jīng)有0人回復(fù)
求ENDNOTE破解軟件安裝包已經(jīng)有4人回復(fù)
誠邀有志之士加入江蘇大學(xué)環(huán)境學(xué)院合成生物學(xué)課題組！(長期接收學(xué)碩專碩、碩博連讀) 已經(jīng)有16人回復(fù)
河海大學(xué) （211.雙一流高校）鈣鈦礦光電實驗室丁勇團(tuán)隊歡迎有志青年！已經(jīng)有3人回復(fù)
一志愿南大理論與計算化學(xué)方向（070300）342分，求調(diào)劑已經(jīng)有1人回復(fù)
歡迎化學(xué)、化工、物理、材料、或計算機(jī)背景的考研咨詢已經(jīng)有0人回復(fù)
黑龍江省原子能研究院化學(xué)課題組招收2026級化學(xué)專業(yè)或化學(xué)相關(guān)專業(yè)碩士生已經(jīng)有0人回復(fù)

» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:

紅外譜圖怎么看已經(jīng)有14人回復(fù)
VASP分子動力學(xué)優(yōu)化的INCAR如下，怎么CONTCAR和POSCAR沒有什么變化��？已經(jīng)有13人回復(fù)
【求助】優(yōu)化結(jié)構(gòu)前后，怎么看原子移動多少已經(jīng)有11人回復(fù)
【分享】處理DOSCAR文件的腳本和程序已經(jīng)有19人回復(fù)
【求助】求助；程序停在L1110 已經(jīng)有9人回復(fù)

1樓 2012-07-06 16:06:52

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

gmy1990

榮譽(yù)版主 (著名寫手)

QC強(qiáng)帖: 1
應(yīng)助: 163 (高中生)
貴賓: 0.782
金幣: 13422.7
散金: 526
紅花: 42
沙發(fā): 4
帖子: 1627
在線: 1019.7小時
蟲號: 745920
注冊: 2009-04-11
專業(yè): 理論和計算化學(xué)
管轄: 量子化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+2 2012-07-06 17:25:02

用可視化軟件，例如gaussview

贊一下

回復(fù)此樓

2樓2012-07-06 16:12:45

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

Siriusgoul

銅蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 266
散金: 200
帖子: 48
在線: 27.4小時
蟲號: 1303115
注冊: 2011-05-22
性別: GG
專業(yè): 理論和計算化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+3 2012-07-06 17:25:34

樓上正解……
看他給的坐標(biāo)文件是什么格式，如果是.mol .pdb .gjf .com 什么的GaussView都輕松搞定，還有類似于簡單的.xyz格式的話chemcraft,DSviewPro也可應(yīng)對，后面?zhèn)z軟件也挺好用的，可用于很多格式。

贊一下

回復(fù)此樓

3樓2012-07-06 17:06:45

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

hustzju

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 12 (小學(xué)生)
金幣: 4132.6
散金: 2166
紅花: 12
帖子: 1256
在線: 259.3小時
蟲號: 617660
注冊: 2008-10-05
性別: GG
專業(yè): 有機(jī)分析

引用回帖:

2樓: Originally posted by gmy1990 at 2012-07-06 16:12:45
用可視化軟件，例如gaussview

這個我知道啊，算完后用這個看嗎問題的。
但現(xiàn)在是只有坐標(biāo)數(shù)據(jù)，沒有其他的，該怎么導(dǎo)入？

贊一下

回復(fù)此樓

4樓2012-07-06 18:53:16

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

hustzju

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 12 (小學(xué)生)
金幣: 4132.6
散金: 2166
紅花: 12
帖子: 1256
在線: 259.3小時
蟲號: 617660
注冊: 2008-10-05
性別: GG
專業(yè): 有機(jī)分析

引用回帖:

3樓: Originally posted by Siriusgoul at 2012-07-06 17:06:45
樓上正解……
看他給的坐標(biāo)文件是什么格式，如果是.mol .pdb .gjf .com 什么的GaussView都輕松搞定，還有類似于簡單的.xyz格式的話chemcraft,DSviewPro也可應(yīng)對，后面?zhèn)z軟件也挺好用的，可用于很多格式。

只有坐標(biāo)如下，該怎么看？
1       6          0       2.208625 -0.236974 -0.051544
2       6          0       1.925269 1.198495 -0.179844
3       6          0       0.690545 1.690312 -0.019408
4       6          0    -0.473454 0.808470 0.358213
5       6          0    -0.230135 -0.654483 0.140890
6       7          0       1.032546 -1.073025 0.105002
7       6          0    -1.850190 1.277727 -0.001033
8       6          0    -2.857332 0.395125 -0.191187
9       6          0    -2.591106 -1.016389 -0.139272
10       6          0    -1.328666 -1.536889 0.029420
11       8          0       3.285627 -0.773684 -0.094914
12       1          0       1.240278 -2.070505 0.058720
13       1          0       2.778553 1.825840 -0.412898
14       1          0       0.496631 2.756521 -0.098514
15       1          0    -0.517874 0.863587 1.475408
16       1          0    -2.022851 2.350254 -0.006126
17       1          0    -3.868253 0.735765 -0.387465
18       1          0    -3.421667 -1.704366 -0.273236
19       1          0    -1.158990 -2.608816 -0.008996

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2012-07-06 18:56:46

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

Siriusgoul

銅蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 266
散金: 200
帖子: 48
在線: 27.4小時
蟲號: 1303115
注冊: 2011-05-22
性別: GG
專業(yè): 理論和計算化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

4樓: Originally posted by hustzju at 2012-07-06 18:53:16
這個我知道啊，算完后用這個看嗎問題的。
但現(xiàn)在是只有坐標(biāo)數(shù)據(jù)，沒有其他的，該怎么導(dǎo)入？...

如果你非要用GaussView的話就稍微加點格式信息參照其他的.mol2或是.gjf文件把它寫成這些格式的，坐標(biāo)部分把你要用的來替換了就成。不過我說了，只有坐標(biāo)數(shù)據(jù)，而且是笛卡爾.xyz數(shù)據(jù)形式的話，可以用其他軟件例如chemcraft等打開哦……希望有幫助，呵呵……

贊一下

回復(fù)此樓

6樓2012-07-06 19:01:22

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

Siriusgoul

銅蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 266
散金: 200
帖子: 48
在線: 27.4小時
蟲號: 1303115
注冊: 2011-05-22
性別: GG
專業(yè): 理論和計算化學(xué)

引用回帖:

5樓: Originally posted by hustzju at 2012-07-06 18:56:46
只有坐標(biāo)如下，該怎么看？
1       6          0       2.208625 -0.236974 -0.051544
2       6          0       1.925269 1.198495 -0.179844
3       6          0       0. ...

嗯，最前面那行就是原子編號，一般要把它換成具體元素符號，改成xyz的最簡單，其他還麻煩，比如：
29
Energy = -1126.741833063
C -5.1211966 -0.1227266 -1.0901835
C -3.8261712 -0.4316819 -0.6922856
C -3.4188691 -0.1889590 0.6238658
C -4.3366821 0.3598495 1.5255061
C -5.6371449 0.6468566 1.1265669
C -6.0345835 0.4117603 -0.1857055
S -1.8082166 -0.6191296 1.2171735
C -0.6378919 0.0511079 -0.1019492
O -1.0752776 0.6057652 -1.0902309
C    0.7081936 -0.2109113 0.2823566
C    1.7668326 0.1807583 -0.5094973
C    3.1512450 0.0134278 -0.3016604
C    4.0749579 0.4924392 -1.2762685
C    5.4264693 0.3584002 -1.1408882
C    6.0218800 -0.2862816 0.0152296
C    5.0636145 -0.7663414 1.0010913
C    3.7174538 -0.6214219 0.8439907
O    7.2558905 -0.4207836 0.1588071
H    0.8634739 -0.7272205 1.2211417
H    1.4891470 0.6906485 -1.4292315
H    3.6699133 0.9813263 -2.1586946
H    6.1054478 0.7324780 -1.8992331
H    5.4735770 -1.2516138 1.8802768
H    3.0531440 -0.9992840 1.6144087
H -5.4198379 -0.3074401 -2.1157092
H -3.1241554 -0.8484892 -1.3988304
H -4.0210031 0.5650948 2.5409998
H -6.3357672 1.0673152 1.8409780
H -7.0444431 0.6450568 -0.5020243
能量就不用管，就只要元素和坐標(biāo)，最上面的數(shù)字是原子數(shù)

贊一下

回復(fù)此樓

7樓2012-07-06 19:08:11

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

hustzju

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 12 (小學(xué)生)
金幣: 4132.6
散金: 2166
紅花: 12
帖子: 1256
在線: 259.3小時
蟲號: 617660
注冊: 2008-10-05
性別: GG
專業(yè): 有機(jī)分析

引用回帖:

7樓: Originally posted by Siriusgoul at 2012-07-06 19:08:11
嗯，最前面那行就是原子編號，一般要把它換成具體元素符號，改成xyz的最簡單，其他還麻煩，比如：
29
Energy = -1126.741833063
C -5.1211966 -0.1227266 -1.0901835
C -3.8261712 -0.4316819 ...

只要換成元素符號就可以嗎？
C                   2.208625 -0.236974 -0.051544
C                   1.925269 1.198495 -0.179844
C                0.690545 1.690312 -0.019408
C                -0.473454 0.808470 0.358213
C                -0.230135 -0.654483 0.140890
N                1.032546 -1.073025 0.105002
C                -1.850190 1.277727 -0.001033
C                -2.857332 0.395125 -0.191187
C                -2.591106 -1.016389 -0.139272
C                -1.328666 -1.536889 0.029420
O                3.285627 -0.773684 -0.094914
H                1.240278 -2.070505 0.058720
H                2.778553 1.825840 -0.412898
H                0.496631 2.756521 -0.098514
H                -0.517874 0.863587 1.475408
H             -2.022851 2.350254 -0.006126
H                -3.868253 0.735765 -0.387465
H             -3.421667 -1.704366 -0.273236
H                -1.158990 -2.608816 -0.008996

贊一下

回復(fù)此樓

8樓2012-07-06 19:52:04

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

Siriusgoul

銅蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 266
散金: 200
帖子: 48
在線: 27.4小時
蟲號: 1303115
注冊: 2011-05-22
性別: GG
專業(yè): 理論和計算化學(xué)

引用回帖:

8樓: Originally posted by hustzju at 2012-07-06 19:52:04
只要換成元素符號就可以嗎？
C                   2.208625 -0.236974 -0.051544
C                   1.925269 1.198495 -0.179844
C                0.690545 1.690312 -0.019408
C    ...

你可以試試，還有，坐標(biāo)數(shù)據(jù)一定要對齊，不能像你在這給出的歪歪扭扭的。注意格式……

贊一下

回復(fù)此樓

9樓2012-07-06 20:59:50

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

nyzhaoyin

新蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 27 (小學(xué)生)
金幣: 1044.9
散金: 112
紅花: 9
帖子: 681
在線: 241.5小時
蟲號: 563016
注冊: 2008-05-24
性別: GG

有坐標(biāo)還不簡單？隨便把坐標(biāo)copy出來修改成gaussview能認(rèn)的格式即可

贊一下

回復(fù)此樓

10樓2012-07-06 21:13:22

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn) 我要訂閱樓主 hustzju 的主題更新

返回列表

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]		作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +7	yangfz 2026-03-17	7/350	2026-03-17 23:57 by 星空星月
[考研] 302求調(diào)劑 +6	呼呼呼。。。。 2026-03-17	6/300	2026-03-17 23:56 by 星空星月
[考研] 材料與化工求調(diào)劑 +6	為學(xué)666 2026-03-16	6/300	2026-03-17 20:15 by peike
[考研] 277調(diào)劑 +5	自由煎餅果子 2026-03-16	6/300	2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985 +4	張vvvv 2026-03-15	6/300	2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 有沒有道鐵/土木的想調(diào)劑南林，給自己招師弟中～ +3	TqlXswl 2026-03-16	7/350	2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自動化所實習(xí) +6	Losir 2026-03-12	7/350	2026-03-17 12:09 by danranxie
[考研] 考研調(diào)劑 +3	淇ya_~ 2026-03-17	5/250	2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 274求調(diào)劑 +5	時間點 2026-03-13	5/250	2026-03-17 07:34 by 熱情沙漠
[考研] [導(dǎo)師推薦]西南科技大學(xué)國防/材料導(dǎo)師推薦 +3	尖角小荷 2026-03-16	6/300	2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 環(huán)境工程調(diào)劑 +6	大可digkids 2026-03-16	6/300	2026-03-16 17:16 by barlinike
[基金申請] 今年的國基金是打分制嗎？ 50+3	zhanghaozhu 2026-03-14	3/150	2026-03-16 17:07 by 北京萊茵潤色
[考研] 304求調(diào)劑 +3	曼殊2266 2026-03-14	3/150	2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 復(fù)試調(diào)劑 +3	呼呼？~+123456 2026-03-14	3/150	2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 招收0805（材料）調(diào)劑 +3	18595523086 2026-03-13	3/150	2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4	快樂的香蕉 2026-03-11	4/200	2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 304求調(diào)劑 +6	Mochaaaa 2026-03-12	7/350	2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] 工科，求調(diào)劑 +3	我887 2026-03-11	3/150	2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 311求調(diào)劑 +3	冬十三 2026-03-13	3/150	2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 283求調(diào)劑，材料、化工皆可 +8	蘇打水7777 2026-03-11	10/500	2026-03-13 09:06 by Linda Hu

24小時熱門版塊排行榜

[求助] 有坐標(biāo)怎么看結(jié)構(gòu)��？

» 猜你喜歡

» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:

【答案】應(yīng)助回帖

【答案】應(yīng)助回帖

【答案】應(yīng)助回帖

[求助] 有坐標(biāo)怎么看結(jié)構(gòu)��？

» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助: