 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 1780 | 回復(fù): 10 | |||
nedved33金蟲 (小有名氣)
|
[求助]
這種形式的坐標(biāo)該怎么得到？
|
|
想對過渡態(tài)做scan，好像要求的坐標(biāo)不是笛卡爾坐標(biāo)，在論壇里的帖子里看到這種形式的坐標(biāo)，我想問下，類似下面這種坐標(biāo)該怎么轉(zhuǎn)換得到？可以自動生成嗎？ %chk=C6H12O2.chk # b3lyp/6-311+g(d,p) scf=maxcycle=1000 scan C6H6O2 0 1 C C 1 B1 C 2 B2 1 A1 C 3 B3 2 A2 1 D1 0 C 4 B4 3 A3 2 D2 0 C 5 B5 4 A4 3 D3 0 O 1 B6 2 A5 3 D4 0 O 6 B7 5 A6 4 D5 0 H 1 B8 7 A7 2 D6 0 H 2 B9 1 A8 7 D7 0 H 3 B10 2 A9 1 D8 0 H 4 B11 3 A10 2 D9 0 H 5 B12 4 A11 3 D10 0 H 6 B13 5 A12 4 D11 0 B1 1.47001481 B2 1.35213504 B3 1.44805746 B4 1.34807607 B5 1.46873534 B6 1.21337327 B7 1.21177979 B8 1.10663924 B9 1.08542210 B10 1.08739136 B11 1.08640585 B12 1.08633080 B13 1.11068087 A1 125.94532223 A2 127.11728249 A3 123.17323344 A4 121.42916035 A5 122.70659721 A6 124.00116584 A7 119.98704577 A8 114.47240470 A9 117.57370885 A10 118.75448281 A11 121.87705051 A12 115.15090368 D1 0.01346178 D2 179.92161275 S 180 1.0 D3 -179.98264803 D4 -179.99936667 D5 179.98132399 D6 -179.99685447 D7 0.01790071 D8 -179.97661468 D9 -0.06752315 D10 0.01014314 D11 -0.01875418 另外想問一下，經(jīng)常在一些帖子里看到震蕩，有能量震蕩，力震蕩，位移震蕩，請問這個是怎么回事，在輸出文件里可以看到嗎？具體該怎么看啊，是不是IRC掃描出來的這種圖 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 Gaussian |
» 猜你喜歡
200年來人們一直無法破解的難題： 氣液臨界點狀態(tài)方程
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
關(guān)于引力延遲下雙星系統(tǒng)角動量不守恒的疑惑---求高手解答！
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有134人回復(fù)
-
已知面上掛了，小學(xué)校實驗方向無平臺，感覺太難了
已經(jīng)有26人回復(fù)
-
求助各位大佬，球球了，在這科薩頭
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
求標(biāo)準(zhǔn)卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
量子點電致發(fā)光器件（QLED）：藍光量子點（QDs）和納米氧化鋅電子傳輸材料
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
需要一個圓偏振光誘導(dǎo)化學(xué)反應(yīng)，請問使用圓偏振光作為光源，應(yīng)該需要哪些設(shè)備搭建
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
求ENDNOTE破解軟件安裝包
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
河海大學(xué) （211.雙一流高校）鈣鈦礦光電實驗室丁勇團隊歡迎有志青年！
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
黑龍江省原子能研究院化學(xué)課題組招收2026級化學(xué)專業(yè)或化學(xué)相關(guān)專業(yè)碩士生
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 在udf里面怎么導(dǎo)入外部數(shù)據(jù)
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 哪位大神來指導(dǎo)下數(shù)字信號處理怎么學(xué)，感激不盡
已經(jīng)有30人回復(fù)
- 量子力學(xué)中波函數(shù)為什么要寫成復(fù)數(shù)形式
已經(jīng)有55人回復(fù)
- 下圖是怎么做的
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【整理】今天整理硬盤上的資料，偶然發(fā)現(xiàn)的好玩的小東西就直接發(fā)上來吧
已經(jīng)有105人回復(fù)
- 【轉(zhuǎn)帖】理解矩陣
已經(jīng)有51人回復(fù)
hustzju
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 12 (小學(xué)生)
- 金幣: 4132.6
- 散金: 2166
- 紅花: 12
- 帖子: 1256
- 在線: 259.3小時
- 蟲號: 617660
- 注冊: 2008-10-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 有機分析
2樓2012-07-09 16:19:01
gmy1990
榮譽版主 (著名寫手)
- QC強帖: 1
- 應(yīng)助: 163 (高中生)
- 貴賓: 0.782
- 金幣: 13422.7
- 散金: 526
- 紅花: 42
- 沙發(fā): 4
- 帖子: 1627
- 在線: 1019.7小時
- 蟲號: 745920
- 注冊: 2009-04-11
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
- 管轄: 量子化學(xué)
3樓2012-07-09 20:04:46
daixing2011
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 127
- 帖子: 26
- 在線: 59.3小時
- 蟲號: 1504994
- 注冊: 2011-11-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+2 2012-07-09 20:58:23
nedved33: 金幣+5, ★★★★★最佳答案 2012-07-11 09:26:10
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+2 2012-07-09 20:58:23
nedved33: 金幣+5, ★★★★★最佳答案 2012-07-11 09:26:10
|
你是要得到那個震蕩的圖嗎 ？？ 自己沒做出過那個圖是吧�。� 那個是優(yōu)化就可以看見的， 比如你優(yōu)化一個結(jié)構(gòu)，得到輸出文件1.log 打開高斯view---file---open----找到1.log----注意，把下面方框里的鉤打上----ok----這不就打開了嗎能看到結(jié)構(gòu)了吧----再點result----optimization---- 好了 曲線出來了 夠詳細(xì)嗎 這個總能量曲線說的就是 優(yōu)化過程中 每一步的能量 如果震蕩了 會造成優(yōu)化不出來 就得適當(dāng)調(diào)節(jié)了 |
4樓2012-07-09 20:14:27
mchen10
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 13 (小學(xué)生)
- 金幣: 1508.2
- 散金: 41
- 紅花: 6
- 帖子: 425
- 在線: 159.5小時
- 蟲號: 695973
- 注冊: 2009-02-04
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
5樓2012-07-10 05:06:26
nedved33
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1476.1
- 散金: 10
- 帖子: 129
- 在線: 48.2小時
- 蟲號: 1358708
- 注冊: 2011-08-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
6樓2012-07-11 09:26:34
nedved33
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1476.1
- 散金: 10
- 帖子: 129
- 在線: 48.2小時
- 蟲號: 1358708
- 注冊: 2011-08-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
7樓2012-07-11 09:27:51
nedved33
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1476.1
- 散金: 10
- 帖子: 129
- 在線: 48.2小時
- 蟲號: 1358708
- 注冊: 2011-08-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
8樓2012-07-11 09:29:51
weiyin1977
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 11 (小學(xué)生)
- 金幣: 690.4
- 帖子: 89
- 在線: 91.2小時
- 蟲號: 1879566
- 注冊: 2012-07-05
- 性別: MM
- 專業(yè): 物理有機化學(xué)
9樓2012-07-11 11:34:08
nedved33
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1476.1
- 散金: 10
- 帖子: 129
- 在線: 48.2小時
- 蟲號: 1358708
- 注冊: 2011-08-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
|
C C 1 1.45231259 C 2 1.45177930 1 107.83199097 C 1 1.44952058 2 108.00481196 3 0.15749167 0 C 4 1.44914021 1 108.11579206 2 -0.03248183 0 C 4 3.14565269 1 87.72104764 2 89.73313775 0 C 6 1.44695371 4 89.61687775 1 -2.28995970 0 C 7 1.45164473 6 108.17532301 4 -87.85908816 0 C 6 1.44898258 4 87.84355427 1 -110.38036368 0 C 8 1.45382778 7 107.90399278 6 0.12519680 0 Fe 10 1.93005963 8 68.14146672 7 58.87656122 0 H 1 1.09338270 4 125.84107418 5 177.69719471 0 H 2 1.09276885 1 125.84371417 4 175.67152182 0 H 5 1.09388148 4 125.48632910 1 -175.83151876 0 H 7 1.09403207 6 125.80921570 4 93.79817582 0 H 8 1.09310117 7 125.83280674 6 -175.84614409 0 H 9 1.09236644 6 125.40835865 4 -93.28015433 0 H 10 1.09239462 8 125.76170978 7 -175.46035241 0 H 6 1.09429780 4 92.27175791 1 123.59630656 0 H 4 1.09391268 1 125.92745526 2 -178.93694302 0 H 3 S 2 125.90936355 1 175.74056549 0 S=1.09026300 按您說的已經(jīng)做到這一步了，然后是不是要手動把這些數(shù)字都弄成變量 比如把最后H和3號碳原子的鍵長設(shè)為S，令S=1.09026300即可 最右邊那一串0是什么意思？我看其他人的輸入文件里好像沒這串0 |
10樓2012-07-11 15:37:58
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 nedved33 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +9 | Ymlll 2026-03-18 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +10 | 妮妮ninicgb 2026-03-15 | 14/700 |
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +15 | 于海海海海 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 求調(diào)劑 +14 | enenenhui 2026-03-13 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 18889395102 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學(xué)求調(diào)劑 +8 | 薛云鵬 2026-03-13 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工求調(diào)劑 +6 | 緒幸與子 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 346求調(diào)劑[0856] +3 | WayneLim327 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +6 | S.H1 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 司空. 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +4 | 冬十三 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 【同濟軟件】軟件（085405）考研求調(diào)劑 +3 | 2026eternal 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +8 | 陌宸希 2026-03-16 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +6 | 困于星晨 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 277調(diào)劑 +5 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求老師收留調(diào)劑 +4 | jiang姜66 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 26考研一志愿中國石油大學(xué)(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|