lren_87

傻子樂

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[求助] 求教：ncbi回復(fù)中identifier應(yīng)該怎么理解？

前幾天向genbank遞交一段序列，隨后收到了一封mail，大意理解了，但是一段話沒能很好的理解，希望有經(jīng)歷的人給我指點(diǎn)一下：
[2] Provide a clone/isolate/strain or other unique identifier
for your record. For a more detailed explanation, see below.
他的解釋如下：
strain vs. clone:

If the sequence was obtained from a cultured isolate, then a strain
identifier is required. (A strain identifier is not the same as a
species epithet. The proper species name of your bacterial isolate is
not required.) Strain identifiers distinguish specific cultures so a
historical continuity can be traced from the parent culture to any
subsequent subculture(s).

This is important when strains differ at an infraspecies level, or,
in some cases, when they have been misidentified and are consequently
reclassified in another species. The strain designation you provide
will serve to distinguish yours from other extant and future isolates
that might be obtained elsewhere. Your isolates do not need to be
deposited in a culture collection in order to have strain designations.
A strain may be designated in any manner: by the name of an individual
or locality, or by a string of numbers and/or letters. For example,
how do you distinguish this culture in your laboratory notebook?

我想知道具體的含義是什么，我該怎么答復(fù)，謝謝。

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大浪淘沙

1樓 2012-07-17 22:58:27

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silicare: 金幣+2, 謝謝參與 2012-07-19 09:15:11

引用回帖:

6樓: Originally posted by lren_87 at 2012-07-18 14:20:37
species epithet
指的的物種的俗名吧？...

species epithet是生物的種名比如Escherichia coli里面的coli

株ID是每個(gè)菌株獨(dú)有的ID 有ATCC NCTC等
估計(jì)他只需要你提供其中之一就可以了
也可能是某個(gè)菌株特有的約定俗成的名字

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7樓2012-07-18 14:31:59

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yqbter: 金幣+2, 鼓勵(lì)發(fā)帖！ 2012-07-18 08:41:59

strain identifier就是strain ID （不是物種名）
他下面詳細(xì)介紹了什么是strain identifier 和使用它的必要性

如果你忘記告訴他那么回復(fù)他正確的strain ID就可以了

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2樓2012-07-18 08:37:49

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2樓: Originally posted by Davidzjy at 2012-07-18 08:37:49
strain identifier就是strain ID （不是物種名）
他下面詳細(xì)介紹了什么是strain identifier 和使用它的必要性

如果你忘記告訴他那么回復(fù)他正確的strain ID就可以了

是不是就是描述清楚界門綱目科屬種就行？

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大浪淘沙

3樓2012-07-18 13:51:00

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引用回帖:

3樓: Originally posted by lren_87 at 2012-07-18 13:51:00
是不是就是描述清楚界門綱目科屬種就行？...

不是的
他在括號(hào)里面特意強(qiáng)調(diào)了不是種類名species epithet
而是株名包括培養(yǎng)環(huán)境等性質(zhì)的那個(gè)

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4樓2012-07-18 13:53:35

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4樓: Originally posted by Davidzjy at 2012-07-18 13:53:35
不是的
他在括號(hào)里面特意強(qiáng)調(diào)了不是種類名species epithet
而是株名包括培養(yǎng)環(huán)境等性質(zhì)的那個(gè)...

那該怎么回復(fù)他？我看到環(huán)境以及地點(diǎn)那個(gè)是針對(duì)第三個(gè)提問的

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大浪淘沙

5樓2012-07-18 14:19:43

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species epithet
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6樓2012-07-18 14:20:37

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可能是分類不清楚吧~~~

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8樓2012-07-20 08:30:47

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wizardfan: 金幣+5, 首貼獎(jiǎng)勵(lì)，以后多發(fā)帖交流 2012-12-20 07:37:12

那樓主咋寫的最后？？？我下午也是收到一樣的郵件了~~~~

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9樓2012-12-19 22:38:55

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9樓: Originally posted by zhaodi3302 at 2012-12-19 22:38:55
那樓主咋寫的最后？？？我下午也是收到一樣的郵件了~~~~

弱弱的問一句您是怎么回復(fù)的？？？？？？

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10樓2013-12-31 10:39:14

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