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77638333金蟲 (著名寫手)
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[求助]
這樣的BLAST結(jié)果如何取舍?
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有時出現(xiàn)2個基因名稱,分別點擊,均有序列,而且不同。那么是按照基因名稱與進(jìn)行比對的基因名稱是否一致,還是按照配對的堿基位置進(jìn)行取舍,或是皆附上? BLAST的目的是為下一步設(shè)計通用引物做準(zhǔn)備。 |

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金蟲 (小有名氣)
金蟲 (著名寫手)

金蟲 (小有名氣)

金蟲 (小有名氣)
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有發(fā)現(xiàn)一個問題,不知道對樓主是否有用: 樓主的query序列不知道是什么,可能是一段基因序列(mRNA吧),而你比對的subject序列式genome序列(看標(biāo)題和subject序列位置),應(yīng)該是整個基因組把。 查了一下Geobacter sulfurreducens是一種革蘭氏陰性菌,轉(zhuǎn)錄后mRNA幾乎沒有加工的,所以才會和基因組DNA比對上。 所以這或許就是一個基因,只是mRNA和它的DNA模板比對上了而已 |

木蟲 (正式寫手)

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