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今夜無風(fēng)銅蟲 (小有名氣)
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真核基因的轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)如何獲得的?
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我對生物學(xué)不是很了解,對基因的轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)有幾點(diǎn)疑問,希望大蝦給與指點(diǎn),謝謝! 編碼基因的轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)距離加A端還有可能有幾個(gè)甚至上千個(gè)bp,轉(zhuǎn)錄后加A以后的序列就被分解掉了,這樣的話如何獲得基因的轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn),在UCSC上下載的人類基因的注釋中含有txEnd,注明基因的轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn),這個(gè)txEnd就是真正的基因的轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)么? 查相關(guān)文獻(xiàn)書基因的轉(zhuǎn)錄終止有兩類,依賴 ρ和不依賴ρ兩類,如何知道一個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄終止是哪一類的,有沒有專門的數(shù)據(jù)庫? |
【分子生物】EPI帖 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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2 非依賴 ρ轉(zhuǎn)錄(Rho-independent transcription)這個(gè)比較簡單 就不貼圖了 RNA靠近終止區(qū)的片段會(huì)形成一種"莖-環(huán)結(jié)構(gòu)"(stem-loop,google一下就有圖片) 可以破壞RNA聚合酶的構(gòu)像(結(jié)構(gòu))從而達(dá)到阻止RNA繼續(xù)合成的目的 與此同時(shí) RNA聚合酶附近的DNA片段富含腺嘌呤(poly-A) 而對應(yīng)合成出來RNA的片段富含尿嘧啶(poly-U) A-U配對是所有堿基對中結(jié)構(gòu)最不穩(wěn)定的 這樣 轉(zhuǎn)錄泡(RNA聚合酶包裹的部分)中的兩股DNA容易恢復(fù)雙鏈 釋放出產(chǎn)物RNA 結(jié)束轉(zhuǎn)錄過程 這種基因的特點(diǎn)是——模板DNA在終止位點(diǎn)附近有特殊的連續(xù)T序列 在連續(xù)T之前有富含GC互補(bǔ)區(qū)及幾個(gè)其他堿基(對應(yīng)RNA中stem-loop的片段) |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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(系統(tǒng)提示我的敘述中包含min gan信息。。。。。 我只好一段一段貼出來 慢慢篩查哪里碰了紅線。。。 請見諒) 確定終止位點(diǎn)還是很容易的 首先不管哪一種終止方式 其序列都有一定的特點(diǎn)(下文詳述) 另外 現(xiàn)在對于轉(zhuǎn)錄的研究主要是對于原核生物(真核生物的mRNA在離開核前就已經(jīng)被剪切修飾過了 無法得知它的變化過程)因此 對mRNA分子進(jìn)行分析就可以得到序列了 不同的基因(即使是同一個(gè)生物 甚至同一個(gè)細(xì)胞中)對應(yīng)的轉(zhuǎn)錄終止方式可能不同 具體的需要進(jìn)行單獨(dú)查對 你所說的txEnd就是基因中對應(yīng)的轉(zhuǎn)錄終止區(qū)域 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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下面詳細(xì)說一下兩種轉(zhuǎn)錄終止方式: 1 依賴 ρ轉(zhuǎn)錄(Rho-dependent transcription)如這個(gè)附件里的圖片所示 http://kuai.xunlei.com/d/GCVTVLNUXZBZ?p=130497 在轉(zhuǎn)錄過程中 Rho的6聚體會(huì)與合成出來的RNA鏈結(jié)合 通過消耗ATP向下游運(yùn)動(dòng) (圖中的rut是rho utilization site就是Rho與RNA的結(jié)合位置 ) RNA聚合酶在合成RNA的過程中會(huì)停在這個(gè)rut對應(yīng)DNA位置下游100bp左右的Rho-sensitive pause site(見圖第二部分) 當(dāng)Rho運(yùn)動(dòng)到RNA聚合酶附近的位置時(shí) 會(huì)消耗ATP而把DNA-RNA雙鏈分開(圖中Rho unwind RNA NA hybrid)這樣 合成好的mRNA就被釋放 而DNA雙鏈也被恢復(fù) 轉(zhuǎn)錄過程結(jié)束 這種基因的特點(diǎn)就是——含有rut(70個(gè)左右,多C少G)和Rho-sensitive pause site |
銅蟲 (小有名氣)
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