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xingyanfei金蟲 (正式寫手)
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[求助]
DNA模擬
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| 請問大家有將DNA變形后，模擬的嗎?有將他們變形成發(fā)卡結(jié)構(gòu)的嗎？都怎么變的呢？有什么軟件改的？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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我做過短片段的DNA模擬，六個(gè)堿基對，在100ns范圍內(nèi)沒發(fā)現(xiàn)明顯形變，只是看到有堿基對打開的情況。 要得到發(fā)夾結(jié)構(gòu)的DNA可能需要額外對DNA施加外力對它形變，即做SMD；或者直接找到發(fā)夾結(jié)構(gòu)進(jìn)行模擬。 我推薦用AMBER程序和AMBER99的力場，這個(gè)力場計(jì)算DNA比較準(zhǔn)確。 |
2樓2012-07-26 14:21:34
zmz148002989
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3樓2012-08-01 12:15:44
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請教tcl命令，如何改變呢？可以加好友嗎？ 4樓2012-08-01 16:34:32
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