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飛行鳥(niǎo)至尊木蟲(chóng) (文壇精英)
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[求助]
怎么畫出delocalized π occupied orbitals？
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請(qǐng)問(wèn)圖片中軌道delocalized π occupied orbitals？怎么用GVIEW畫出來(lái)呀？感謝。 |
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zhou2009
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【答案】應(yīng)助回帖
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畫對(duì)應(yīng)的電子密度圖的步驟： 首先、加關(guān)鍵詞output=wfn，得到wfn文件： 其次、要在輸出文件的MO系數(shù)部分找到你要的delocalized π occupied orbitals那個(gè)軌道。該軌道垂直于分子軌道的基組有值且同相位。記住這個(gè)軌道的編號(hào)； 第三、將得到的wfn文件讀入multiwfn，對(duì)那個(gè)軌道編號(hào)的MO作電子密度并得cub文件； 最后、GView讀入cub文件，并作圖。 [ Last edited by zhou2009 on 2012-7-27 at 11:45 ] |
5樓2012-07-27 11:43:15
xyz7819227
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2樓2012-07-26 16:46:32
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
飛行鳥(niǎo): 金幣+1, ★有幫助, 很好 2012-07-27 11:14:35
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在你計(jì)算的各MO中，有一個(gè)是這樣的完全同相位的π occupied orbitals，沒(méi)有節(jié)面，它是能量最低的π orbitals。把它在GVIEW畫出來(lái)，調(diào)整等值面的值就可以得到，或者這個(gè)圖本就是delocalized π occupied orbitals對(duì)應(yīng)的電子密度圖。 [ Last edited by zhou2009 on 2012-7-26 at 20:47 ] |
3樓2012-07-26 20:35:07
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8樓2012-07-28 11:57:25
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9樓2012-07-29 17:55:54
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【答案】應(yīng)助回帖
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用GV雖然能直接作出HOMO，但是你所需要的不一定是HOMO。 特別是你所示的圖，它就不是HOMO。這時(shí)的HOMO出現(xiàn)許多反相位的節(jié)面，不是你圖示的delocalized π。 特別是有孤對(duì)電子時(shí)，它可能就是HOMO，它不是delocalized π軌道。 還是要學(xué)會(huì)看軌道、分析軌道、找到你需要的delocalized π軌道，而不總是HOMO，這里的HOMO不是你需要的delocalized π軌道，因?yàn)镠OMO有許多反相位的節(jié)面。 [ Last edited by zhou2009 on 2012-7-29 at 19:45 ] |
10樓2012-07-29 19:31:25
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