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紫菱Kitty金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
有沒(méi)有人會(huì)正交優(yōu)化培養(yǎng)基？
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| 我問(wèn)實(shí)驗(yàn)室的人了，都說(shuō)應(yīng)該設(shè)計(jì)互相影響的正交表。我本科沒(méi)學(xué)過(guò)概率論與數(shù)理統(tǒng)計(jì)，讀研期間數(shù)理統(tǒng)計(jì)只學(xué)了半個(gè)學(xué)期，正交實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)那老師還沒(méi)講。自己看書(shū)看不懂。所以想問(wèn)一下，各個(gè)成分互相影響的正交表怎么設(shè)計(jì)？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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silicare: 金幣+5, BioEPI+1, 鼓勵(lì)發(fā)帖交流 2012-07-31 16:09:40
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先去百度下載一個(gè)軟件，正交設(shè)計(jì)助手，非常簡(jiǎn)單的界面，選好你要設(shè)定的因素和水平，軟件會(huì)自動(dòng)幫你生成正交實(shí)驗(yàn)方案，你照著做就行了。 正交的因素和水平建議你先做做單因素的預(yù)試驗(yàn)，確定一下有顯著性影響的因素，初步選定變化最大的水平范圍，然后再去設(shè)計(jì)正交實(shí)驗(yàn)，否則做不出顯著性差異，實(shí)驗(yàn)就不成立了。 培養(yǎng)基優(yōu)化我以前做過(guò)5年多，有啥問(wèn)題歡迎再問(wèn) |
2樓2012-07-30 09:25:46
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
silicare: 回帖置頂 2012-07-31 16:10:12
silicare: 金幣+5 2012-07-31 16:10:14
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silicare: 金幣+5 2012-07-31 16:10:14
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既然是做正交實(shí)驗(yàn)，那肯定是考慮到有相互影響的，不然就沒(méi)必要做正交了。 單因素實(shí)驗(yàn)的話(huà)，我解釋一下吧，比如基礎(chǔ)培養(yǎng)基，考慮到微量元素的話(huà)，可能有10種以上的成分，那么你不可能去做10多個(gè)因素的正交吧？所以我們要先測(cè)試一下，每種成分加和不加，加多少，到底有多重要。 設(shè)定某些必須的組分為固定濃度，比如基礎(chǔ)的碳源和氮源，其余的組分就一個(gè)一個(gè)的試，如果你打算做4水平的，那么你就可以設(shè)定7個(gè)點(diǎn)以上的單因素，12點(diǎn)以上的當(dāng)然更好……做出曲線之后，有沒(méi)有顯著性，那個(gè)范圍的影響最大，一目了然，你的水平就可以定了，如果做出來(lái)的曲線根本沒(méi)有起伏，那你就不用考察這個(gè)因素了，定個(gè)固定值就OK了。 至于響應(yīng)面分析，個(gè)人不建議新手去考慮，只會(huì)讓你的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)更糟。用于微生物培養(yǎng)的培養(yǎng)基，去做響應(yīng)面，個(gè)人覺(jué)得，就跟你用10萬(wàn)級(jí)天平去配生理鹽水是一個(gè)道理，有必要么？ |
8樓2012-07-31 15:33:54
【答案】應(yīng)助回帖
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silicare: BioEPI+1 2012-07-31 16:28:29
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silicare: BioEPI+1 2012-07-31 16:28:29
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補(bǔ)充一下，正交實(shí)驗(yàn)一般是必須做出至少一個(gè)以上的顯著性因素，如果你都不知道影響最大的水平范圍，直接去做正交，可能有以下兩個(gè)后果： 一，你設(shè)定的水平范圍沒(méi)有包括到最顯著的范圍，也就是選錯(cuò)水平了 二，你設(shè)定的水平范圍夠大，包括到了最顯著的范圍，但是，給你舉個(gè)例子，比如你設(shè)定了成分A的濃度為5g/L，10g/L，15g/L和20g/L，你的運(yùn)氣不錯(cuò)，做出來(lái)的最佳組合結(jié)果是10g/L最佳，那么我要問(wèn)你，7.5g/L和12.5g/L，就一定比10g/L差么？你無(wú)法回答，因?yàn)槟銢](méi)有一個(gè)完整的單因素曲線。 最后補(bǔ)充一點(diǎn)，假設(shè)你做單因素實(shí)驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)了因素A的最佳條件是5g/L，但是最后正交實(shí)驗(yàn)的結(jié)果未必就是它，這是多因素交互影響的結(jié)果，很正常，并不意味著你的實(shí)驗(yàn)有問(wèn)題，你反而可以從中得出更多的假設(shè)和結(jié)論。 |
9樓2012-07-31 15:41:08
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