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[求助] 高斯view怎么打開(kāi)分子軌道

打不開(kāi)這個(gè)fchk文件的分子軌道，同時(shí)算的幾個(gè)沒(méi)有分子篩籠的分子都可以，不知道是不是由于有分子篩籠，希望能得到大家的幫助，謝謝啦！

已經(jīng)排出了用到的兩個(gè)基組的影響。不知道怎么樣才能看到，只要看到high layer部分的分子軌道就好。

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2012-08-16 10:14:57, 13.78 M

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1樓 2012-08-16 10:18:33

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

正常應(yīng)該可以打開(kāi), 不會(huì)受分子篩籠的影響. 檢查一下:1)總原子個(gè)數(shù)是否超過(guò)300個(gè)? 2)優(yōu)化是否正常結(jié)束并收斂?

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2樓2012-08-16 16:49:51

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問(wèn)題補(bǔ)充：Surface/Contours... 是灰色的。

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3樓2012-08-16 17:05:37

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引用回帖:

2樓: Originally posted by zeolitedft at 2012-08-16 16:49:51
正常應(yīng)該可以打開(kāi), 不會(huì)受分子篩籠的影響. 檢查一下:1)總原子個(gè)數(shù)是否超過(guò)300個(gè)? 2)優(yōu)化是否正常結(jié)束并收斂?

總共有217個(gè)原子，優(yōu)化正常結(jié)束。我用的gv版本是5.0.8，優(yōu)化正常結(jié)束。使用的命令是# opt freq oniom(m062x/6-31+g(d):am1) geom=connectivity
有分子篩籠的都打不開(kāi)。
問(wèn)一下：超過(guò)300個(gè)就打不開(kāi)了嗎？

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4樓2012-08-16 17:10:39

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lchhct: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 感謝你的幫助。 2012-08-17 10:58:58

如果正常結(jié)束就不是原子個(gè)數(shù)問(wèn)題. fchk文件太大不好下, 把log文件最后幾行傳上來(lái)幫你看下. 另外,fchk文件打開(kāi)后要在分子軌道選項(xiàng)中計(jì)算你想要的軌道,然后才顯示. 你確定你可以看到小分子的軌道?

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5樓2012-08-16 17:27:00

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引用回帖:

5樓: Originally posted by zeolitedft at 2012-08-16 17:27:00
如果正常結(jié)束就不是原子個(gè)數(shù)問(wèn)題. fchk文件太大不好下, 把log文件最后幾行傳上來(lái)幫你看下. 另外,fchk文件打開(kāi)后要在分子軌道選項(xiàng)中計(jì)算你想要的軌道,然后才顯示. 你確定你可以看到小分子的軌道?

確定可以看到小分子的軌道。這個(gè)大分子是根本連Surface/Contours... 都是灰色的。log最后結(jié)尾就是正常的一句名言啊。。。其他什么都沒(méi)有問(wèn)題，就是fchk打開(kāi)不能點(diǎn)Surface/Contours... 了。
這是log文件最后幾行：
ALMOST ANYTHING IS EASIER TO GET INTO THAN OUT OF.

                     -- AGNES ALLEN'S LAW FROM
            PAUL DICKSON'S "THE OFFICIAL RULES"
Job cpu time:  0 days  8 hours 56 minutes  9.8 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=  32380 Int=    0 D2E=    0 Chk=    97 Scr=    1
Normal termination of Gaussian 09 at Wed Aug 15 10:05:10 2012.

順便再問(wèn)一下能否只看high layer部分的分子軌道。

如果可以的話麻煩下載一下文件，謝謝啦！

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6樓2012-08-16 18:36:26

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搞不懂你的文件為什么會(huì)出現(xiàn)這種情況. 我們做過(guò)的,可以看到軌道,而且都是高層的,因?yàn)楦邔硬庞肈FT處理,所以可以看到軌道. 等網(wǎng)絡(luò)不忙時(shí)下載你的fchk文件,看看再說(shuō)吧

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7樓2012-08-16 20:32:04

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7樓: Originally posted by zeolitedft at 2012-08-16 20:32:04
搞不懂你的文件為什么會(huì)出現(xiàn)這種情況. 我們做過(guò)的,可以看到軌道,而且都是高層的,因?yàn)楦邔硬庞肈FT處理,所以可以看到軌道. 等網(wǎng)絡(luò)不忙時(shí)下載你的fchk文件,看看再說(shuō)吧

好的，謝謝啦！不過(guò)我的分層低層的半經(jīng)驗(yàn)方法處理的小分子也可以看到分子軌道。我真是崩潰了。正在整理論文需要這個(gè)軌道圖。麻煩你啦。

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8樓2012-08-16 21:28:43

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8樓: Originally posted by lchhct at 2012-08-16 21:28:43
好的，謝謝啦！不過(guò)我的分層低層的半經(jīng)驗(yàn)方法處理的小分子也可以看到分子軌道。我真是崩潰了。正在整理論文需要這個(gè)軌道圖。麻煩你啦。...

可以做的這是做出的 homo軌道

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9樓2012-08-17 09:07:45

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9樓: Originally posted by zeolitedft at 2012-08-17 09:07:45
可以做的這是做出的 homo軌道
44/18/970157_1345165653_378.jpg
...

是的，我想得到的就是這個(gè)圖，可是我的文件打開(kāi)后surfaces是灰色的不能點(diǎn)啊。。。不知道你是否知道為什么。

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10樓2012-08-17 10:51:56

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