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redhua新蟲 (初入文壇)
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[求助]
有誰做過古細(xì)菌的454測序？
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我想用454測序測定樣品中的古細(xì)菌多樣性。 那去測序之前，應(yīng)該如何進行樣品處理？ PCR引物，條件等 謝謝！ |
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anyanqiu
銀蟲 (初入文壇)
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- 性別: MM
- 專業(yè): 發(fā)育生物學(xué)
| 你這樣品中只含有古細(xì)菌嗎，如果是的話直接利用宏基因組測序（利用的是16srRNA的方法，引物有可參考的）就可以，這種方法可以分析不同樣品中的古細(xì)菌種類差異和每種古細(xì)菌的數(shù)量差異，但是如果你想從樣品中分離出古細(xì)菌，那你就只能找到古細(xì)菌特異的引物了，不過應(yīng)該很難做到。實在沒有辦法時就只能利用宏基因組方法，加大測序深度，從中挖掘出古細(xì)菌的信息，不過這種方法，數(shù)據(jù)分析較難啊。可以利用anan_1223@sina.com這個郵箱聯(lián)系我，或者你可以給我個郵箱，我把相關(guān)信息發(fā)給你看看，呵呵！ |
2樓2012-09-07 07:50:24
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