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shiyiwenren至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
MS中虛原子的應(yīng)用 已有1人參與
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在一些MS模擬氣體在沸石分子篩中的吸附的時候發(fā)現(xiàn)有時候會需要用到虛原子，如N2模型會采用中間是一個帶電荷的虛原子，兩端的N原子也帶電荷，該虛原子是不具有質(zhì)量的。有時候沸石分子篩結(jié)構(gòu)還有多種不同尺度的籠或者孔道，有些籠或者孔道比吸附氣體的范德華半徑小，為了避免模擬時氣體分子進入此，一般會在這些籠或者孔中加入虛原子，加入虛原子具有恰當?shù)姆兜氯A半徑。那么： （1）這些虛原子在MS建模的時候一般是用那種原子來表示的，對于原子的選擇有什么要求，如原子半徑 （2）虛原子的范德華半徑怎么查看，是在力場參數(shù)里嗎，還是這個是可以自己定義的？ （3）虛原子在模擬的時候力場參數(shù)應(yīng)該如何設(shè)置。在MS中有很多的力場包括dreiding，UFF，CVFF，compass等。是不是虛原子應(yīng)該在范德華作用描述（一般用L-J勢描述）應(yīng)該將相關(guān)的參數(shù)都設(shè)置為零？在MS中提供的力場編輯器目前我使用的版本只能對dreiding力場進行編輯。如果我使用的是其它力場，那么力場參數(shù)自己設(shè)置應(yīng)該怎么進行？ [ Last edited by shiyiwenren on 2012-9-6 at 16:25 ] |
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