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shiyiwenren至尊木蟲 (著名寫手)
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MS中虛原子的應(yīng)用 已有1人參與
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在一些MS模擬氣體在沸石分子篩中的吸附的時(shí)候發(fā)現(xiàn)有時(shí)候會(huì)需要用到虛原子,如N2模型會(huì)采用中間是一個(gè)帶電荷的虛原子,兩端的N原子也帶電荷,該虛原子是不具有質(zhì)量的。有時(shí)候沸石分子篩結(jié)構(gòu)還有多種不同尺度的籠或者孔道,有些籠或者孔道比吸附氣體的范德華半徑小,為了避免模擬時(shí)氣體分子進(jìn)入此,一般會(huì)在這些籠或者孔中加入虛原子,加入虛原子具有恰當(dāng)?shù)姆兜氯A半徑。那么: (1)這些虛原子在MS建模的時(shí)候一般是用那種原子來表示的,對(duì)于原子的選擇有什么要求,如原子半徑 (2)虛原子的范德華半徑怎么查看,是在力場(chǎng)參數(shù)里嗎,還是這個(gè)是可以自己定義的? (3)虛原子在模擬的時(shí)候力場(chǎng)參數(shù)應(yīng)該如何設(shè)置。在MS中有很多的力場(chǎng)包括dreiding,UFF,CVFF,compass等。是不是虛原子應(yīng)該在范德華作用描述(一般用L-J勢(shì)描述)應(yīng)該將相關(guān)的參數(shù)都設(shè)置為零?在MS中提供的力場(chǎng)編輯器目前我使用的版本只能對(duì)dreiding力場(chǎng)進(jìn)行編輯。如果我使用的是其它力場(chǎng),那么力場(chǎng)參數(shù)自己設(shè)置應(yīng)該怎么進(jìn)行? [ Last edited by shiyiwenren on 2012-9-6 at 16:25 ] |
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