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[求助] 求助高斯計(jì)算后處理的一個(gè)細(xì)節(jié)問題

大家好，在這里提一個(gè)高斯計(jì)算的細(xì)節(jié)問題，懇請(qǐng)細(xì)心指教：
配合物使用linux計(jì)算，優(yōu)化完成后，導(dǎo)出其fchk文件，然后windows界面下用gaussianview查看其優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)，以及用Gaussianview工具欄上的Mos查看HOMO及LUMO軌道，現(xiàn)在的問題是，結(jié)構(gòu)優(yōu)化完成后，金屬與配體的鍵在gaussianview上不顯示，雖然對(duì)結(jié)果沒影響，但是顯示HOMO，LUMO軌道時(shí)，鍵也是沒有的，這樣在作報(bào)告寫論文的時(shí)候，就很難看了。我嘗試將這個(gè)鍵補(bǔ)上，但是補(bǔ)上后，MOS就出不來了，可能認(rèn)為是一個(gè)新的結(jié)構(gòu)，所以無法查看了。所以請(qǐng)教大家，怎么才能不影響計(jì)算結(jié)果的情況下將鍵顯示出來，謝謝了！

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1樓 2012-09-10 09:47:56

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【答案】應(yīng)助回帖

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這有何難，你打開結(jié)果文件，把它存成一個(gè)新的輸入文件。
接下來想怎么編輯都行了，你應(yīng)該會(huì)做了吧。

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2樓2012-09-10 11:01:02

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【答案】應(yīng)助回帖

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對(duì)，樓上說的很對(duì)，復(fù)制編輯成新的文件。就可以了。

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快樂吧

3樓2012-09-11 08:40:44

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2樓: Originally posted by liucg407 at 2012-09-10 11:01:02
這有何難，你打開結(jié)果文件，把它存成一個(gè)新的輸入文件。
接下來想怎么編輯都行了，你應(yīng)該會(huì)做了吧。

謝謝你的回答，可能你沒懂我的意思，按你的方法，變成一個(gè)輸入文件后，沒有任何關(guān)于我計(jì)算的東西了，更不用提我所要的HOMO,LUMO軌道圖了，我需要得到的是HOMO等軌道的分布圖，并且這個(gè)分布圖上的配位鍵能都顯示出來。

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4樓2012-09-11 08:57:15

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3樓: Originally posted by 飛行鳥 at 2012-09-11 08:40:44
對(duì)，樓上說的很對(duì)，復(fù)制編輯成新的文件。就可以了。

你好，我不是想要一個(gè)優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)圖，而是想優(yōu)化后的軌道分布圖，編輯后是沒辦法查看這些計(jì)算后才有的信息的

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5樓2012-09-11 08:58:47

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xxjiang

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我也遇到過這種情況，原因可能是你最初輸入文件分子的結(jié)構(gòu)與優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)相差太大導(dǎo)致的，建議你在重新調(diào)整一下輸入結(jié)構(gòu)在重新算一下

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6樓2012-09-11 10:58:51

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6樓: Originally posted by xxjiang at 2012-09-11 10:58:51
我也遇到過這種情況，原因可能是你最初輸入文件分子的結(jié)構(gòu)與優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)相差太大導(dǎo)致的，建議你在重新調(diào)整一下輸入結(jié)構(gòu)在重新算一下

試過了，而且基組有加大的，還是不行

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7樓2012-09-11 16:36:18

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【答案】應(yīng)助回帖

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5樓: Originally posted by oneil at 2012-09-11 08:58:47
你好，我不是想要一個(gè)優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)圖，而是想優(yōu)化后的軌道分布圖，編輯后是沒辦法查看這些計(jì)算后才有的信息的...

這個(gè)問題，在GaussView里確實(shí)不好解決。VMD就容易解決，VMD可以先純粹導(dǎo)入一個(gè)分子結(jié)構(gòu)，然后導(dǎo)入你想顯示的cube

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8樓2012-09-11 17:06:18

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