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【求助】高斯計算td的問題
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我想算一個物質(zhì)在乙腈溶液中的紫外圖譜 輸入文件如下 #p rb3lyp/genecp td=(singlet,nstates=15) scrf=(iefpcm,solvent=acetonitrile) 0 1 分子坐標(biāo) C H N 0 6-31G(d) **** Mn Cl 0 6-31G+(d,p) 運(yùn)算時總是提示下面的錯誤 Leave Link 202 at Mon Mar 28 10:31:45 2011, MaxMem= 268435456 cpu: 0.3 (Enter /opt/g03/l301.exe) General basis read from cards: (5D, 7F) Centers: 1 2 3 5 6 7 8 10 11 12 13 14 16 17 18 19 20 22 23 24 Centers: 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 Centers: 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 Centers: 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 4 9 15 21 6-31G(d) **** Centers: 77 78 6-31g+(d,p) QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE. ' Last state="Top" TCursr= 746 LCursr= 0 Error reading general basis specification. Error termination via Lnk1e in /opt/g03/l301.exe at Mon Mar 28 10:31:47 2011. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 7.2 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 13 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 注：分子坐標(biāo)是先通過b3lyp/6-31g幾何優(yōu)化后，再導(dǎo)出的得到的 想知道如何改如何修正才能得到我想要的結(jié)果，現(xiàn)在這樣的錯誤原因是什么，希望各位達(dá)人能夠不吝賜教。 |
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ellemiu(金幣+2): 哪里的語法錯了，能不能說的詳細(xì)一點(diǎn) 2011-03-28 18:26:31
375642546(金幣+1): 謝謝! 2011-04-08 09:58:16
ellemiu(金幣+2): 哪里的語法錯了，能不能說的詳細(xì)一點(diǎn) 2011-03-28 18:26:31
375642546(金幣+1): 謝謝! 2011-04-08 09:58:16
| 語法錯誤 |
2樓2011-03-28 12:00:36
3樓2011-03-28 20:09:03
ellemiu(金幣+1): 多謝來訪。。 2011-03-29 00:37:40
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本帖內(nèi)容被屏蔽 |
4樓2011-03-29 00:35:26
5樓2011-03-29 09:21:37
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375642546(金幣+1): 謝謝！ 2011-04-08 09:57:37
ellemiu(金幣+10): 謝謝，多謝指點(diǎn)，，看了你寫的明白了很多，不過還是沒有發(fā)現(xiàn)我錯誤的地方 2011-04-08 17:15:51
375642546(金幣+1): 謝謝！ 2011-04-08 09:57:37
ellemiu(金幣+10): 謝謝，多謝指點(diǎn)，，看了你寫的明白了很多，不過還是沒有發(fā)現(xiàn)我錯誤的地方 2011-04-08 17:15:51
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給你一個例子： 螢光範(fàn)例： Acetaldehyde ?牡諞患ぐl(fā)態(tài)（n→π*） 放射的螢光 現(xiàn)在?硌芯窟@個迴圈： Acetaldehyde 激發(fā)和放射迴圈 這裡感興趣的過程是放射（emission），這個範(fàn)例顯示如何完整激發(fā)和放射迴圈的溶液效應(yīng)進(jìn)行研究。 步驟 1: 基態(tài)幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)選和頻率計算（平衡溶解）。這是分子包含 PCM 平衡溶解的基態(tài)標(biāo)準(zhǔn)的 Opt Freq 計算。 %chk=01-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) Opt Freq SCRF=(Solvent=Ethanol) Acetaldehyde ground state 0 1 C C,1,RA X,2,1.,1,A O,2,RB,3,A,1,180.,0 X,1,1.,2,90.,3,0.,0 H,1,R1,2,A1,5,0.,0 H,1,R23,2,A23,5,B23,0 H,1,R23,2,A23,5,-B23,0 H,2,R4,1,A4,3,180.,0 RA=1.53643 RB=1.21718 R1=1.08516 R23=1.08688 R4=1.10433 A=62.1511 A1=110.51212 A23=109.88119 A4=114.26114 B23=120.56468 步驟 2: 垂直激發(fā)，線性回應(yīng)溶解模型。這是垂直激發(fā)的 TD-DFT 計算，因此採用基態(tài)平衡幾結(jié)構(gòu)，加上預(yù)設(shè)的溶解模型：線性回應(yīng)，非平衡狀態(tài)。進(jìn)行單結(jié)構(gòu) TD-DFT 計算，預(yù)設(shè)選項採用非平衡溶解模型。這計算工作的結(jié)果用?碚頁瞿男顟B(tài)是感興趣的狀態(tài)，以及這些狀態(tài)的次序。這些結(jié)果提供激發(fā)態(tài)溶解的合理描述，但還是不及特定狀態(tài)的溶解計算所得的結(jié)果。在這個範(fàn)例中， 越遷 n->π* 狀態(tài)是第一個激發(fā)態(tài)。下一步，使用特定狀態(tài)方法產(chǎn)生垂直激發(fā)步驟較佳的描述。 %chk=02-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) TD=NStates=6 SCRF=(Solvent=Ethanol) Geom=Check Guess=Read Acetaldehyde: linear response vertical excited states 0 1 步驟 3: 垂直激發(fā)的特定狀態(tài)溶解模型。需要兩個工作步驟：第一先做分子基態(tài)計算，在 PCM 輸入段落中指定NonEq=write，將基態(tài)非平衡溶解模型的計算結(jié)果儲存起?懟５詼糠謅M行真正的指定狀態(tài)計算，用 NonEq=read ?臋z查檔讀回所需的資料進(jìn)行非平衡溶解模型計算。 %chk=03-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) SCRF=(Solvent=Ethanol,Read) Geom=Check Guess=Read Acetaldehyde: prepare for state-specific non-eq solvation by saving the solvent reaction field from the ground state 0 1 NonEq=write --link1-- %chk=03-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) TD(NStates=6,Root=1) SCRF=(Solvent=Ethanol,StateSpecific,Read) Geom=Check Guess=Read Acetaldehyde: read non-eq solvation from ground state and compute energy of the first excited with the state-specific method 0 1 NonEq=read 步驟 4: 激發(fā)態(tài)幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)選計算。 接下?�，進(jìn)行一次 TD-DFT 幾何優(yōu)選計算，採用平衡線性回應(yīng)溶解模型，找出激發(fā)態(tài)位能曲面的最低能量結(jié)構(gòu)。因為這是一個 TD-DFT 邀選計算，程式預(yù)設(shè)的選項是平衡溶解模型。像這種典型的情況，基態(tài)的分子有平面對稱性，但在激發(fā)態(tài)時，這對稱性就被破壞了，因此在優(yōu)選計算開始的時候就將基態(tài)幾何結(jié)構(gòu)做稍微的擾動，將對稱性破壞，往後的優(yōu)選計算才能順利進(jìn)行。 %chk=04-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) TD=(Read,NStates=6,Root=1) SCRF=(Solvent=Ethanol) Geom=Modify Guess=Read Opt=RCFC Acetaldehyde: excited state opt Modify geometry to break Cs symmetry since first excited state is A" 0 1 4 1 2 3 10.0 5 1 2 7 -50.0 步驟 5: 激發(fā)態(tài)分子結(jié)構(gòu)的振動頻率。現(xiàn)在執(zhí)行頻率計算，確認(rèn)步驟 4 找到的幾何結(jié)構(gòu)是在能量曲面的最低點(diǎn)。若有需要，計算結(jié)果也可被用?磉M(jìn)行 Franck-Condon 計算（見後面的討論）。這是一個數(shù)值頻率計算。 %chk=05-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) TD=(Read,NStates=6,Root=1) Freq SCRF=(Solvent=Ethanol) Geom=Check Guess=Read Acetaldehyde excited state freq 0 1 步驟 6: 溶液中特定狀態(tài)的電子放射(部分 1)。這步驟進(jìn)行分子激發(fā)態(tài)在其平衡幾何結(jié)構(gòu)上的特定狀態(tài)平衡溶解計算，用 PCM NonEq=write 將溶解數(shù)據(jù)寫道檢查檔，給下一步計算工作使用。 %chk=06-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) TD=(Read,NStates=6,Root=1) SCRF=(Solvent=Ethanol,StateSpecific,Read) Geom=Check Guess=Read Acetaldehyde emission state-specific solvation at first excited state optimized geometry 0 1 NonEq=write 步驟 7: 電子放射到分子基態(tài)（部分 2）。最後，用非平衡溶解模型計算基態(tài)能量，使用激發(fā)態(tài)的幾何結(jié)構(gòu)和激發(fā)態(tài)的靜態(tài)溶解模型。 %chk=07-ac # B3LYP/6-31+G(d,p) SCRF=(Solvent=Ethanol,Read) Geom=Check Guess=Read Acetaldehyde: ground state non-equilibrium at excited state geometry. 0 1 NonEq=read 步驟 1，2，和 4 足夠用?磧嬎銡庀嚳腫擁募ぐl(fā)和放射能量（再用步驟 5 確認(rèn)穩(wěn)定點(diǎn)的特性）。當(dāng)要考慮溶液效應(yīng)時，這幾步驟的計算就不夠了，因為步驟 4 計算的能量相當(dāng)於溶劑反應(yīng)場的基態(tài)，而回應(yīng)激發(fā)態(tài)電荷分?旬a(chǎn)生在反應(yīng)場內(nèi)發(fā)生的放射。步驟 6 和 7 對這溶劑效應(yīng)做適當(dāng)?shù)奶幚怼? |
6樓2011-04-07 22:03:25
7樓2011-04-08 03:30:55
魚妃
金蟲 (著名寫手)
- QC強(qiáng)帖: 2
- 應(yīng)助: 20 (小學(xué)生)
- 貴賓: 4.743
- 金幣: 1069.4
- 帖子: 1181
- 在線: 360.3小時
- 蟲號: 947811
8樓2011-04-08 09:50:38
ellemiu(金幣+3): 謝謝指教，我查了說明書確實如你所說，不過我后來將基組改成了Lanl2dz計算Mn原子，用6-31g計算C、H、N、Cl原子，依然出現(xiàn)同樣的錯誤 2011-04-08 17:23:50
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我來說說我的看法吧，首先lz的出錯原因：語法錯誤，基組關(guān)鍵詞寫錯了。 lz應(yīng)該是想寫6-31+g（d,p）吧？結(jié)果寫成了6-31g+（d,p）了？ 其實想用6-31g+（d,p）也是可以的，這是George Petersson等人開發(fā)的基組，高斯中也包含這種基組，只是這種基組不這樣寫罷了。如6-31g+的關(guān)鍵詞是6-31g(d')。 參考：高斯說明書。  |
9樓2011-04-08 09:55:50
10樓2011-04-08 12:41:15
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