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ellemiu

鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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[交流] 【求助】高斯計(jì)算td的問(wèn)題

我想算一個(gè)物質(zhì)在乙腈溶液中的紫外圖譜
輸入文件如下

#p rb3lyp/genecp td=(singlet,nstates=15) scrf=(iefpcm,solvent=acetonitrile)

0 1
分子坐標(biāo)

C H N 0
6-31G(d)
****
Mn Cl 0
6-31G+(d,p)

運(yùn)算時(shí)總是提示下面的錯(cuò)誤

Leave Link  202 at Mon Mar 28 10:31:45 2011, MaxMem=  268435456 cpu:    0.3
(Enter /opt/g03/l301.exe)
General basis read from cards:  (5D, 7F)
Centers: 1  2  3  5  6  7  8 10 11 12 13 14 16 17 18 19 20 22 23 24
Centers:  25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44
Centers:  45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64
Centers:  65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76  4  9 15 21
6-31G(d)
****
Centers:  77 78
6-31g+(d,p)

  QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE.

'
Last state="Top"
TCursr=  746 LCursr= 0
Error reading general basis specification.
Error termination via Lnk1e in /opt/g03/l301.exe at Mon Mar 28 10:31:47 2011.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  7.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    13 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1

注：分子坐標(biāo)是先通過(guò)b3lyp/6-31g幾何優(yōu)化后，再導(dǎo)出的得到的

想知道如何改如何修正才能得到我想要的結(jié)果，現(xiàn)在這樣的錯(cuò)誤原因是什么，希望各位達(dá)人能夠不吝賜教。

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1樓 2011-03-28 11:11:47

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daiyulan85

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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ellemiu(金幣+1): 6-31g都是常用的基組，不太明白你說(shuō)的錯(cuò)誤是指？ 2011-03-29 00:36:21
375642546(金幣+1): 謝謝！ 2011-04-08 09:58:06

Error reading general basis specification

會(huì)不會(huì)是基組錯(cuò)誤？

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3樓2011-03-28 20:09:03

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shangji2

金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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ellemiu(金幣+1): 哥，指點(diǎn)下迷津，我加你 2011-03-29 17:12:13

這個(gè)小問(wèn)題，QQ談，多給點(diǎn)金幣啊，83842088

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5樓2011-03-29 09:21:37

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woxiangfei

木蟲(chóng) (文壇精英)

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★
375642546(金幣+1): 謝謝！ 2011-04-08 09:57:37
ellemiu(金幣+10): 謝謝，多謝指點(diǎn)，，看了你寫(xiě)的明白了很多，不過(guò)還是沒(méi)有發(fā)現(xiàn)我錯(cuò)誤的地方 2011-04-08 17:15:51

給你一個(gè)例子：

螢光範(fàn)例： Acetaldehyde ?牡諞患ぐl(fā)態(tài)（n→π*）放射的螢光
現(xiàn)在?硌芯窟@個(gè)迴圈：

Acetaldehyde 激發(fā)和放射迴圈
這裡感興趣的過(guò)程是放射（emission），這個(gè)範(fàn)例顯示如何完整激發(fā)和放射迴圈的溶液效應(yīng)進(jìn)行研究。
步驟 1: 基態(tài)幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)選和頻率計(jì)算（平衡溶解）。這是分子包含 PCM 平衡溶解的基態(tài)標(biāo)準(zhǔn)的 Opt Freq 計(jì)算。
%chk=01-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) Opt Freq SCRF=(Solvent=Ethanol)

Acetaldehyde ground state

0 1
C
C,1,RA
X,2,1.,1,A
O,2,RB,3,A,1,180.,0
X,1,1.,2,90.,3,0.,0
H,1,R1,2,A1,5,0.,0
H,1,R23,2,A23,5,B23,0
H,1,R23,2,A23,5,-B23,0
H,2,R4,1,A4,3,180.,0

RA=1.53643
RB=1.21718
R1=1.08516
R23=1.08688
R4=1.10433
A=62.1511
A1=110.51212
A23=109.88119
A4=114.26114
B23=120.56468
步驟 2: 垂直激發(fā)，線性回應(yīng)溶解模型。這是垂直激發(fā)的 TD-DFT 計(jì)算，因此採(cǎi)用基態(tài)平衡幾結(jié)構(gòu)，加上預(yù)設(shè)的溶解模型：線性回應(yīng)，非平衡狀態(tài)。進(jìn)行單結(jié)構(gòu) TD-DFT 計(jì)算，預(yù)設(shè)選項(xiàng)採(cǎi)用非平衡溶解模型。這計(jì)算工作的結(jié)果用?碚頁(yè)瞿男顟B(tài)是感興趣的狀態(tài)，以及這些狀態(tài)的次序。這些結(jié)果提供激發(fā)態(tài)溶解的合理描述，但還是不及特定狀態(tài)的溶解計(jì)算所得的結(jié)果。在這個(gè)範(fàn)例中，越遷 n->π* 狀態(tài)是第一個(gè)激發(fā)態(tài)。下一步，使用特定狀態(tài)方法產(chǎn)生垂直激發(fā)步驟較佳的描述。
%chk=02-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) TD=NStates=6 SCRF=(Solvent=Ethanol)
Geom=Check Guess=Read

Acetaldehyde: linear response vertical excited states

0 1
步驟 3: 垂直激發(fā)的特定狀態(tài)溶解模型。需要兩個(gè)工作步驟：第一先做分子基態(tài)計(jì)算，在 PCM 輸入段落中指定NonEq=write，將基態(tài)非平衡溶解模型的計(jì)算結(jié)果儲(chǔ)存起?懟５詼糠謅M行真正的指定狀態(tài)計(jì)算，用 NonEq=read ?臋z查檔讀回所需的資料進(jìn)行非平衡溶解模型計(jì)算。
%chk=03-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) SCRF=(Solvent=Ethanol,Read)
Geom=Check Guess=Read

Acetaldehyde: prepare for state-specific non-eq solvation
by saving the solvent reaction field from the ground state

0 1

NonEq=write

--link1--
%chk=03-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) TD(NStates=6,Root=1)
SCRF=(Solvent=Ethanol,StateSpecific,Read)
Geom=Check Guess=Read

Acetaldehyde: read non-eq solvation from ground state and
compute energy of the first excited with the state-specific method

0 1

NonEq=read
步驟 4: 激發(fā)態(tài)幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)選計(jì)算。接下?�，進(jìn)行一次 TD-DFT 幾何優(yōu)選計(jì)算，採(cǎi)用平衡線性回應(yīng)溶解模型，找出激發(fā)態(tài)位能曲面的最低能量結(jié)構(gòu)。因?yàn)檫@是一個(gè) TD-DFT 邀選計(jì)算，程式預(yù)設(shè)的選項(xiàng)是平衡溶解模型。像這種典型的情況，基態(tài)的分子有平面對(duì)稱(chēng)性，但在激發(fā)態(tài)時(shí)，這對(duì)稱(chēng)性就被破壞了，因此在優(yōu)選計(jì)算開(kāi)始的時(shí)候就將基態(tài)幾何結(jié)構(gòu)做稍微的擾動(dòng)，將對(duì)稱(chēng)性破壞，往後的優(yōu)選計(jì)算才能順利進(jìn)行。
%chk=04-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) TD=(Read,NStates=6,Root=1) SCRF=(Solvent=Ethanol)
Geom=Modify Guess=Read Opt=RCFC

Acetaldehyde: excited state opt
Modify geometry to break Cs symmetry
since first excited state is A"

0 1

4 1 2 3 10.0
5 1 2 7 -50.0
步驟 5: 激發(fā)態(tài)分子結(jié)構(gòu)的振動(dòng)頻率�，F(xiàn)在執(zhí)行頻率計(jì)算，確認(rèn)步驟 4 找到的幾何結(jié)構(gòu)是在能量曲面的最低點(diǎn)。若有需要，計(jì)算結(jié)果也可被用?磉M(jìn)行 Franck-Condon 計(jì)算（見(jiàn)後面的討論）。這是一個(gè)數(shù)值頻率計(jì)算。
%chk=05-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) TD=(Read,NStates=6,Root=1) Freq
SCRF=(Solvent=Ethanol) Geom=Check Guess=Read

Acetaldehyde excited state freq

0 1
步驟 6: 溶液中特定狀態(tài)的電子放射(部分 1)。這步驟進(jìn)行分子激發(fā)態(tài)在其平衡幾何結(jié)構(gòu)上的特定狀態(tài)平衡溶解計(jì)算，用 PCM NonEq=write 將溶解數(shù)據(jù)寫(xiě)道檢查檔，給下一步計(jì)算工作使用。
%chk=06-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) TD=(Read,NStates=6,Root=1)
SCRF=(Solvent=Ethanol,StateSpecific,Read)
Geom=Check Guess=Read

Acetaldehyde emission state-specific solvation
at first excited state optimized geometry

0 1

NonEq=write
步驟 7: 電子放射到分子基態(tài)（部分 2）。最後，用非平衡溶解模型計(jì)算基態(tài)能量，使用激發(fā)態(tài)的幾何結(jié)構(gòu)和激發(fā)態(tài)的靜態(tài)溶解模型。
%chk=07-ac
# B3LYP/6-31+G(d,p) SCRF=(Solvent=Ethanol,Read) Geom=Check Guess=Read

Acetaldehyde: ground state non-equilibrium
at excited state geometry.

0 1

NonEq=read
步驟 1，2，和 4 足夠用?磧嬎銡庀嚳腫擁募ぐl(fā)和放射能量（再用步驟 5 確認(rèn)穩(wěn)定點(diǎn)的特性）。當(dāng)要考慮溶液效應(yīng)時(shí)，這幾步驟的計(jì)算就不夠了，因?yàn)椴襟E 4 計(jì)算的能量相當(dāng)於溶劑反應(yīng)場(chǎng)的基態(tài)，而回應(yīng)激發(fā)態(tài)電荷分?旬a(chǎn)生在反應(yīng)場(chǎng)內(nèi)發(fā)生的放射。步驟 6 和 7 對(duì)這溶劑效應(yīng)做適當(dāng)?shù)奶幚怼?

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6樓2011-04-07 22:03:25

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yongma2008

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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375642546: 其實(shí)也有這種基組，只是不常用而已！ 2011-04-08 09:43:58
ellemiu(金幣+1): 謝謝來(lái)訪，其實(shí)是我寫(xiě)錯(cuò)，不過(guò)我剛研究了下說(shuō)明書(shū)，這個(gè)基組也是存在的 2011-04-08 17:20:02

6-31G+(d,p)，第一次見(jiàn)這種寫(xiě)法

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7樓2011-04-08 03:30:55

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