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[求助]
lammps read_data 文件格式
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xx47513樓2012-09-12 22:07:59
lchchl
銅蟲 (小有名氣)
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2樓2012-09-12 19:03:41
Tanya_snail
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
jiaoyixiong: 金幣+5, 贊！講解的真細致！ 2012-09-13 09:53:11
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jiaoyixiong: 金幣+5, 贊！講解的真細致！ 2012-09-13 09:53:11
| data文件有兩種格式，一種是二進制文件，一種是ascii文件，一般來說，我們可以看到的都屬于ascii文件。ascii文件由兩部分組成，一是文件頭，二是原子信息。文件頭包括一些說明的內(nèi)容，還有原子數(shù)、鍵類型數(shù)、盒子的三維坐標上下界等一系列信息，原子信息部分就包括了每個原子的ID，三維坐標，類型等等信息，根據(jù)你選的atom_type不同，顯示的內(nèi)容也不一定相同。但至少都包括有原子ID以及坐標的信息。vmd中關(guān)于輸出data文件的命令的完整格式為：topo writelammpsdata filename atom_type，在atom_type缺省的情況下默認為full。至于不同的atom_type有什么區(qū)別，參見lammps官方手冊中atom_type的部分。這里要說明一點，lammps里面有一個命令叫write_restart，這個命令輸出的data文件是二進制文件，所以我們使用文本編輯器打開之后看到的都是01這樣的二進制數(shù)，可以使用一些小程序?qū)⒍M制文件轉(zhuǎn)換成文本文件（ascii文件），這些程序lammps工具包里有。 |
4樓2012-09-13 09:48:13
5樓2012-09-14 15:23:45
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